24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1142  |  回复: 17
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


[交流] 【交流】Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法(共享)

Ubuntu 8.04 安装Sybyl7.3 的方法

第一步 安装Ubuntu8.04 做好linux系统的准备。

第二步 从新立得软件包管理器中安装Gmout-iso 软件 (虚拟光驱挂载软件)。

第三步 从新立得软件包管理器中安装搜索yum,选择yum和python-sqlitecachec,这两个软件安装;接下来搜索libmotif3,安装。 ------(此处是做好sybyl所需库的准备,以防后面报错。)

第四步 打开终端, $ sudo chomd 777 /usr/tmp/ ----给用户添加 /usr/tmp/文件夹的读写执行权限,这样就可以让用户直接安装sybyl7.3,不必要使用root超级用户了。

第五步 挂载iso虚拟光驱,打开 应用程序-系统工具-Gmout-iso,挂载你的sybyl7.3的第一张光盘。(以后的在安装过程中也用样的挂载光盘)

第六步 开始安装sybyl ,打开终端 $ /media/cdrom/install.sh ----执行sybyl的安装文件。
这个路径是我挂载光盘的位置,请根据自己的挂载光盘的位置来填写。

第七步 为sybyl找到license的来源,crack里面,设置sybyl的安装路径等,这里是窗口对话模式,自己填上就可以了,如同windows的软件安装一样。

Ok! 安装开始,完成第一张光盘后会提示你挂载第二张,第三张,第四张光盘。

最后的是启动,目前还是只能每次启动输入3个命令。

进入 AdminTools10.8/bin/linux 文件

$ cd /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux ----我放 AdminTools10.8的位置在/home/caixin
$ ./lmgrd triposlm
$ ./sybyl

当然你也可以做个软连接(相当于windows下的快捷方式)来启动。
$ ln /home/caixin/AdminTools10.8/bin/linux /home/caixin


到这里在Ubuntu8.04下sybyl7.3的安装就完成了。这是个人心得和安装方法,在自己摸索中总结出来的,希望能让初学者少走弯路,尽快接触sybyl7.3

声明:本文参考aspirin001作者的《ubuntu7.04下安装sybyl7.3》, 在此十分感谢aspirin001把自己的安装过程共享。我只是在这个基础上简化了安装过程,并指出不用安装python2.1,只需要yum和python-sqlitecachec就可以了。

PS:另外,如果是做分子对接的话,建议使用sybyl8.0的 surflex,效果比7.3有很大提高。:)

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-15 at 13:34 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lj623

金虫 (小有名气)

sybyl8.0升级补丁在哪?
另我已安装了蛋白数据库,同源模建还是不能用
12楼2008-11-20 09:15:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

xufund

至尊木虫 (知名作家)

xie xie fen xiang
2楼2008-11-14 20:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)


:)呵呵 欢迎大家一起讨论 sybyl 的 使用哦,还有遇到的问题
3楼2008-11-14 21:13:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xufund

至尊木虫 (知名作家)

楼主。按照您的方法,我在ubuntu8.04下安装了sybyl8.0。但是无法运行surflex。其它几个对接程序也无法运行。请问您有这个问题吗?
4楼2008-11-17 21:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见