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vigaryang

木虫 (正式写手)

[求助] VASP计算中分子的poscar如何构建? 已有1人参与

我想计算分子在晶体表面的吸附,因此需要对分子结构进行优化。通过教程,我了解到分子的poscar也可由cif文件转化而来,但分子的cif文件该如何构建呢?同时,这个cif的晶胞参数该设置为多少Å呢?盼不吝赐教!
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by vigaryang at 2016-08-07 11:43:47
谢谢回复。那么分子的cif文件是怎么构建或者生成得到的呢?...

有坐标等信息就用ms软件来构建,找到原子位置等信息,Build-crystals
                                build-add atoms
                               file-export
愿不负最苦的时光
4楼2016-08-07 11:45:49
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vigaryang: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2016-08-07 13:45:59
把cif文件用vesta打开,输出里面选取POSCAR格式,生成以后用vi编辑器打开。。你的问题就解决了
愿不负最苦的时光
2楼2016-08-07 11:15:12
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vigaryang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-08-07 11:15:12
把cif文件用vesta打开,输出里面选取POSCAR格式,生成以后用vi编辑器打开。。你的问题就解决了

谢谢回复。那么分子的cif文件是怎么构建或者生成得到的呢?
3楼2016-08-07 11:43:47
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vigaryang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 蛋蛋小童鞋 at 2016-08-07 11:45:49
有坐标等信息就用ms软件来构建,找到原子位置等信息,Build-crystals
                                build-add atoms
                               file-export...

不能在ms里画好一个分子,将其黏贴到空的晶胞中的任一位置吗?
5楼2016-08-07 12:46:47
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