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2368126698

新虫 (小有名气)

[求助] 复现氧气在超临界水中的无限系数扩散情况,得到的氧气的msd非线性 已有1人参与

最近复现了一个氧气在超临界水中的无限稀释扩散的案例,但是尽管增加时间步数,还是得不到线性的均方位移曲线,文献中时间步长为1方式,弛豫步长为125000步,统计平均步数为500000步。我复现了该文献的步数,甚至做了一组800000步的模拟,得到的曲线始终是非线性的,请问大家是否有什么建议?谢谢!

附上的图片中,线性的是水,非线性的是氧气。由于氧气的线性度不高,所以不知道如何求其扩散系数。

复现氧气在超临界水中的无限系数扩散情况,得到的氧气的msd非线性
S60806-152421.jpg
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

你的文字中的错别字和语法错误太多,很不好理解。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-08-07 03:40:07
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2368126698

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-08-07 03:40:07
你的文字中的错别字和语法错误太多,很不好理解。

抱歉,我想表达的意思是求氧气在超临界水中的无限稀释扩散系数的时候,得到的均方位移曲线不是线性的,所以不知道如何求其系数,不知您是否有什么建议?
谢谢
3楼2016-08-07 17:05:33
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
2368126698: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-08-07 18:51:51
2368126698: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-08-07 18:52:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-08-07 17:05:33
抱歉,我想表达的意思是求氧气在超临界水中的无限稀释扩散系数的时候,得到的均方位移曲线不是线性的,所以不知道如何求其系数,不知您是否有什么建议?
谢谢...

也许是模拟时间和次数不够,但也许是模拟过程有问题。你最好给出你参考的文献。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
4楼2016-08-07 18:25:30
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2368126698

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by brucefan at 2016-08-07 18:25:30
也许是模拟时间和次数不够,但也许是模拟过程有问题。你最好给出你参考的文献。
...

复现的参考文献是肖吉等人写的《超临界水中气体扩散系数的分子动力学模拟》,高效化学工程学报 第15卷第1期,2001年2月。
另外模拟的时间个人觉得已经很长了,甚至比文献都长的模拟时间也试了一下,但是得到的均方位移曲线还是非线性,不知针对这种情况,是否有什么建议?
谢谢!
5楼2016-08-07 18:50:58
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AB577295592

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-08-07 18:50:58
复现的参考文献是肖吉等人写的《超临界水中气体扩散系数的分子动力学模拟》,高效化学工程学报 第15卷第1期,2001年2月。
另外模拟的时间个人觉得已经很长了,甚至比文献都长的模拟时间也试了一下,但是得到的均方 ...

你是只用一个分子的吗?
6楼2016-08-10 16:49:07
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2368126698

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by AB577295592 at 2016-08-10 16:49:07
你是只用一个分子的吗?...

一个盒子,含有255个水分子,一个氧气分子

发自小木虫Android客户端
7楼2016-08-10 22:44:22
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强智明

铜虫 (初入文坛)

你好,我能和你交流下ME这个软件吗?在这个软件中怎样对构建的模型进行退火处理,设置完温度,找不到在哪运行?
8楼2017-11-28 15:32:56
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zx108s221

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-08-10 22:44:22
一个盒子,含有255个水分子,一个氧气分子
...

1个分子怎么可能线性? 文中也没有提到MSD是线性的 只是给了最后的结果 我自己也试过 根本不可能的
只能说他这个数值肯定是线性回归得到的结果
我还是不太建议你用1个分子 现在计算能力强的多了 你可以把体系放大一些
另外无限稀释也并不一定只能1个分子 浓度在1%左右也基本满足
I'maslowlywalker,butIneverwalkback.
9楼2017-11-29 22:04:56
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逗比装傲娇

新虫 (初入文坛)

请问你解决了吗
10楼2018-01-10 21:20:28
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