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proteinwang

铜虫 (正式写手)

[交流] 连接出了怪现象!

各位大虾好,最进进行了2批连接试验,但是结果有点怪,描述一下,大家帮忙看看出了什么问题哦!
质粒载体为pUC18(2.68kb),目的片段为0.9kb(为一抗生素基因),采用单酶切HindⅢ。
puc18和目的片段37度条件下酶切6h,酶切体系按照说明书配制,酶切后对puc18进行了电泳检测,其得到了很好的酶切。目的片段因为酶切下来的片段较小,无法验证酶切结果。
目的片段,试剂盒回收,puc18经80度20min失活内切酶后直接用于连接。

按照T4 DNA连接酶说明操作,过夜连接。CaCl2法转化。因为我的目的片段是一个抗性基因,在含有相应抗生物的平板上筛选到了转化子。
公得到9各转化子,提取质粒DNA,HindⅢ酶切,电泳验证。结果只切出了一条带,条带长度为8Kb。按照推断HindⅢ酶切后应该得到pUC18片段和目的片段为0.9kb,但是却得到了这么大的片段。
利用转化子质粒为模板进行pcR扩增还得到了我的目的片段。
这真是怪了!!
请大家帮忙分析一下原因吧,谢谢!
另外,单酶切进行连接时必须进行去磷酸化处理吗?应该怎样操作才能得到比较高的连接和转化效率呢?
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zhaoxiag

银虫 (小有名气)

我也曾经遇到过这样的情况
你可以加大酶切体系中质粒的量
可能质粒的量太少切出来的0.9kb的片段量太少电泳检测不出来
2楼2008-11-14 12:32:42
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zhaoxiag

银虫 (小有名气)

你也可以将酶切后的目的片段和载体的片段做个胶回收,然后连接转化提质粒
3楼2008-11-14 12:37:03
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snow889

这个大片断会不会是没有切开的质粒?
我觉得质粒最好进行去磷酸化处理。
4楼2008-11-15 02:47:31
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proteinwang

铜虫 (正式写手)

酶切后的片段我是做了胶回收的。
另外,大片段可能是没有切开的质粒,但是即使没有没切开,片段的分子量也是不对的。
5楼2008-11-17 10:57:38
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断弦的琴

铁虫 (小有名气)

单酶切 不去磷酸化  很难连上去

你没有必要酶切6h  因为HindIII在3小时后就几乎没有效果了
你可以加大目的片段的量,减少载体的量。比如10ul体系 你就加0.5ul载体。
没有必要严格遵守什么公式

PS:900bp 酶切下来是完全可以看见的
回收时候是肯定可以看见的
不知道失去了多少以后我们能不再痛苦,不知道偿多少冷暖以后我们能看破生命.
6楼2008-11-19 22:21:37
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proteinwang

铜虫 (正式写手)

谢谢楼上的朋友,我再做一下试验,如有结果汇报上来。
7楼2008-11-20 19:24:02
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