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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

[求助] VASP 一些小程序的使用 已有1人参与

在运行VASP的时候,一些小程序怎么使用呀?比如,在优化晶格参数的时候,看例子,上面写了这个程序,如果我想使用,怎么使用?需要改动那里?小弟是新手,求大神指教。详细点最好啦!再次感谢!如果在Liunx下运行,是怎么运行的呀?

VASP 一些小程序的使用
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天呐6_8

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


蛋蛋小童鞋: 金币+1, 鼓励积极回答问题 2016-08-04 10:28:55
可以sh 加上脚本名  
也可以sh <脚本名
还可以chmod +x 脚本名  然后./脚本名
3楼2016-08-03 21:05:48
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天呐6_8

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by daixiujuan52 at 2016-08-03 21:11:39
谢谢亲,我想问下怎么在系统下运行这个程序呢?需要改动什么嗯?...

将for i in 后面的数改为你想要设的
将中J间POSCAR部分改成你的POSCAR
将POSCAR中的晶格常数比例系数改为$i
7楼2016-08-03 21:20:13
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天呐6_8

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
daixiujuan52: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-05 16:08:08
如果你是在linux单机上运行 这样就可以了   如果说要提交给集群任务 用qsub 加脚本,那当然脚本还需要改动,具体的改动因集群而异,也可以单独加个PBS。
10楼2016-08-05 11:06:29
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普通回帖

天呐6_8

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
蛋蛋小童鞋: 金币+1, 鼓励回答问题详细者 2016-08-04 10:28:28
这是个简单优化晶格常数的脚本,通过改变变量$i的大小 中间一部分就是POSCAR ,$i是POSCAR 晶格常数的比例系数 for后面有9个不同的i 一共带入运算9次, 每一次都会得到一个i和能量的关系写在SUMMARY文本里,然后带入origin作图 拟合 能带最低点对应最优化的晶格常数
2楼2016-08-03 20:57:37
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天呐6_8 at 2016-08-03 20:57:37
这是个简单优化晶格常数的脚本,通过改变变量$i的大小 中间一部分就是POSCAR ,$i是POSCAR 晶格常数的比例系数 for后面有9个不同的i 一共带入运算9次, 每一次都会得到一个i和能量的关系写在SUMMARY文本里,然后带入 ...

谢谢亲,我想问下怎么在系统下运行这个程序呢?需要改动什么嗯?
4楼2016-08-03 21:11:39
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 天呐6_8 at 2016-08-03 21:05:48
可以sh 加上脚本名  
也可以sh <脚本名
还可以chmod +x 脚本名  然后./脚本名

谢谢大神,不过我我没看懂。我对linux的系统不是很了解,现在初开始学,想问下,这个在系统下怎么运行呢?
5楼2016-08-03 21:12:29
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天呐6_8

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
daixiujuan52: 金币+20 2016-08-03 21:31:29
引用回帖:
5楼: Originally posted by daixiujuan52 at 2016-08-03 21:12:29
谢谢大神,不过我我没看懂。我对linux的系统不是很了解,现在初开始学,想问下,这个在系统下怎么运行呢?...

右键打开终端  输入sh 后面加上你的脚本名

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2016-08-03 21:15:53
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 天呐6_8 at 2016-08-03 21:15:53
右键打开终端  输入sh 后面加上你的脚本名...

谢谢,您的意思这个脚本是放在一个文件里面,然后我在超算上,输入sh 脚本名 就可以了吧
8楼2016-08-03 21:31:21
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天呐6_8

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by daixiujuan52 at 2016-08-03 21:31:21
谢谢,您的意思这个脚本是放在一个文件里面,然后我在超算上,输入sh 脚本名 就可以了吧...

不知道你是单机跑  还是集群跑
9楼2016-08-05 11:01:06
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