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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 求助大神，GROMACS中模拟膜蛋白中添加离子时出现不能识别的原子类型
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疯狂的鬼马

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助大神，GROMACS中模拟膜蛋白中添加离子时出现不能识别的原子类型 已有2人参与

在运行GROMACS教程DPPC膜中的KALP15添加离子时如下错误：
Fatal error:
Atomtype LC3 not found
  
有大神知道是为什么吗  新手上路 请大家帮帮忙
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1楼 2016-08-01 21:26:42
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G、sir

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

说明力场文件里没有啊
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2楼2016-08-11 08:15:37
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juvejones

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

先在离子那个itp文件里找到对应的atomtype，然后去ffnonbonded.itp,atomtypes.atp里面确认是不是有这个atomtype。没有的话，手动添加即可。
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3楼2016-08-12 23:14:49
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