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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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疯狂的鬼马

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助大神,GROMACS中模拟膜蛋白中添加离子时出现不能识别的原子类型 已有2人参与

在运行GROMACS教程DPPC膜中的KALP15添加离子时如下错误:
Fatal error:
Atomtype LC3 not found
  
有大神知道是为什么吗  新手上路 请大家帮帮忙
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G、sir

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

说明力场文件里没有啊
2楼2016-08-11 08:15:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

juvejones

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

先在离子那个itp文件里找到对应的atomtype,然后去ffnonbonded.itp,atomtypes.atp里面确认是不是有这个atomtype。没有的话,手动添加即可。
3楼2016-08-12 23:14:49
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