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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？
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加油August

新虫 (正式写手)

[求助] 菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？ 已有1人参与

菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？
开头的“S625......................1273”指的是什么？

菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？
360桌面截图20160728100609.jpg


菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？-1
360桌面截图20160728100629.jpg
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1楼 2016-07-28 10:08:41
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小小橘子君

新虫 (初入文坛)
你好，请问楼主你做的和测定16S RNA是一个吗？

发自小木虫IOS客户端
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4楼2016-09-24 16:18:30
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
S625......................1273
S625样本的测序序列长度为1273bp
构建系统发育树用mega软件进行。
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2楼2016-07-29 14:15:14
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加油August

新虫 (正式写手)
用MEGA做了系统发育树，并申请GenBank登录号，结果见附件。问题是：GenBank登录号为什么是“Seq 1"，而不是字母+数字，比如”KU317914.1“；感觉做出的系统发育树好奇怪，是这样的吗？
谢谢！
菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？-2
360桌面截图20160730161325.jpg


菌株16S rDNA测序结果，如何分析构建系统发育树，确定菌株种属？-3
360桌面截图20160730161407.jpg
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3楼2016-07-30 16:18:36
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star013

新虫 (知名作家)
我们可以帮您提供分析技术服务

发自小木虫Android客户端
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5楼2016-09-25 09:47:45
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