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加油August

新虫 (正式写手)

[求助] 菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属? 已有1人参与

菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属?
开头的“S625......................1273”指的是什么?

菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属?
360桌面截图20160728100609.jpg


菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属?-1
360桌面截图20160728100629.jpg
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
S625......................1273
S625样本的测序序列长度为1273bp
构建系统发育树用mega软件进行。
2楼2016-07-29 14:15:14
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加油August

新虫 (正式写手)

用MEGA做了系统发育树,并申请GenBank登录号,结果见附件。问题是:GenBank登录号为什么是“Seq 1",而不是字母+数字,比如”KU317914.1“;感觉做出的系统发育树好奇怪,是这样的吗?
谢谢!
菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属?-2
360桌面截图20160730161325.jpg


菌株16S rDNA测序结果,如何分析构建系统发育树,确定菌株种属?-3
360桌面截图20160730161407.jpg

3楼2016-07-30 16:18:36
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小小橘子君

新虫 (初入文坛)

你好,请问楼主你做的和测定16S RNA是一个吗?

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-09-24 16:18:30
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以帮您提供分析技术服务

发自小木虫Android客户端
5楼2016-09-25 09:47:45
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彭翠珍

新虫 (初入文坛)

你好,请问你分析好了吗

发自小木虫IOS客户端
6楼2017-06-21 07:53:25
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