| 查看: 847 | 回复: 4 | ||||
jianjunjiang铁杆木虫 (正式写手)
|
[求助]
分子动力学模拟过程中，任何两个原子的距离都不能超过该方向上边长的一半吗？
|
|
各位大侠： 周期性边界条件下，在某一方向上，分子动力学模拟过程中，任何两个原子的距离都不能超过该方向上边长的一半吗？ 比如说，某一时刻，某一水分子中的两个氢原子，假设他们在水平方向的坐标分别为0.1L和0.8L（L为盒子在水平方向的边长），那么这两个氢原子水平方向的中心坐标是（0.1L+0.8L)/2+0.5L=0.95L或者（0.1L+0.8L)/2-0.5L=-0.05L吗？ 期待您的答复！ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有10人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有11人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有9人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有10人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有12人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
2楼2016-07-24 00:22:33
jianjunjiang
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 8344.2
- 散金: 60
- 红花: 1
- 帖子: 932
- 在线: 252.1小时
- 虫号: 509147
- 注册: 2008-02-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2016-07-24 00:42:11
brucefan
专家顾问 (著名写手)
-
专家经验: +218 - 模拟EPI: 4
- 应助: 422 (硕士)
- 金币: 2294.8
- 散金: 1720
- 红花: 88
- 帖子: 1423
- 在线: 670.2小时
- 虫号: 3048965
- 注册: 2014-03-14
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
- 管辖: 分子模拟
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jianjunjiang: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-07-24 04:52:22
月只蓝: 金币+5, 感谢指导！ 2016-07-24 14:35:59
jianjunjiang: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-07-24 04:52:22
月只蓝: 金币+5, 感谢指导！ 2016-07-24 14:35:59
|
那应该先将其中一个原子平移一个盒子长度，例如将0.1平移到1.1，然后与0.8求平均值，得到0.95。这就是两个氢原子的中心。如果你平移另一个原子，那么中心是-0.05，与0.95是等价的。这就是所谓的最小镜像约定。然后，当你计算氧原子与这个中心的位置差矢量时，同样要用最小镜像约定。你画个图就清楚了。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
4楼2016-07-24 02:10:32
jianjunjiang
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 8344.2
- 散金: 60
- 红花: 1
- 帖子: 932
- 在线: 252.1小时
- 虫号: 509147
- 注册: 2008-02-22
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2016-07-24 04:52:25
10