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chendengtai

木虫 (正式写手)

[交流] 谁有APEX 2软件,分享一下

谁有“APEX 系列晶体学软件”,我想下载但是找不到!




应用软件
APEX 系列晶体学软件

可提供Windows XP和Linux Fedora Core3应用版本。

APEX2软件有一个全新的方法,使用户与晶体学实验相互感知和作用。图形用户界面能够引导用户以最少量的用户输入和最大量的图形反馈来完成整个的实验。这个GUI(图形用户界面)引导用户集中注意于眼前的结构测定,而不要求对于仪器几何原理或数据收集策略具备任何知识。即使是新手,使用APEX2 也很容易,但APEX2又具备晶体学专家要求的所有功能。

该软件从通过数据收集、数据积分、求比例因子而获取衍射数据开始,直到解出结构,进行精修,并产生实验报告为止,每一步都会提供最高质量的结果。只需用鼠标点一下,直观的图形用户界面就会启动数据收集或数据积分模块,并且对于结构测定过程中的进展情况和质量都会提供明了易懂的反馈。数据获取、晶胞测定、数据积分和求比例因子等各步骤所用的基本工具都已经改进了算法并因此而能产生出上佳的数据。

APEX2软件系列采用了服务器客户机的设置来进行数据收集和数据处理。服务器计算机连接到仪器上并控制这个系统,而运行更高层次晶体学软件的客户计算机则通过局域网连接到服务器上。这样做有几点好处:

    * 晶体学软件可以从几乎任何地方与仪器相连接。这样,用户就可以在他的办公室方便地进行实验
    * 这样就可以把仪器控制与晶体学应用清楚地分开,用户就可以只需关注他的晶体学实验
    * 服务器可以允许多重连接,这样,就可以从各个地方同时监控实验

SHELXTL

适当版本的SHELXTL现已完全融入到APEX2并可以得到其Windows和Linux版本。对于由Goettingen大学的Sheldrick教授开发和维护的各种强有力和可靠的工具,APEX2都加上了现代化的图形用户界面(GUIs)。在学术界和产业界,SHELXTL程序包都是进行结构求解和精修的黄金标准。SHELXTL程序系列包括:XPREP,进行空间群指派,数据的统计学评估,数字吸收校正,计算得到的Patterson截面的展示,缺面对称孪晶等等。SABADS,求比例因子和多重扫描吸收校正。XS,XL,和XM形成结构求解和精修的核心。XP和XSHELL提供原子和分子图形以便容易和直观地进行交互式结构精修。XCIF用于从标准CIF文件生成结构报告,并且安排其格式以便直接提交给杂志和数据库保存。

程序包的所有程序都能以一条命令行的这种最基本的专家模式而得以运行。

晶胞测定

    Unit cell determination

快速傅立叶和差值矢量技术的一种新颖结合可以使最困难的数据也能被可靠地指标化。伴有图形反馈的全矩阵非线性最小二乘方晶胞精修,解决反射点的重叠问题,布拉维格子测定以及进行矩阵处理的许多工具,完美地构成了这个模块。这个插件可以用全自动模式,一个按钮操作就完成;或者,也可以一步一步地进行,以便最大程度地发挥用户的创造性。


晶面指数标定

    Face indexing

要标定出尺寸!为了进行数字吸收校正,需要把晶体描绘出来,这只要点几下鼠标就可以完成了。借助于一些容易使用的工具和聪明的助手,从记录下来的晶体影像测定晶体形状。


成像分析

    Image Analysis

直观的APEX2图形界面提供所有的成像分析工具,包括图像放大和镜头移动,三维视图,图表列队,摇摆曲线,分辨率环等等…


数据积分

    Data Integration

使用针对窄扫描和宽扫描最优化了的算法完成三维真积分。对于化学晶体学以及更具有挑战性的数据,例如孪晶和无公度结构数据,进行最好和最快的积分。在进行浮动积分时,伴有详细的反馈信息,包括积分进展和质量,三维反射线形状,多组分反射点的重叠等等。


倒易格子观看器

    Reciprocal lattice viewer

展示以及交互式修改反射阵列。从基本上是无定形的散射体中提取出人造物品。从视觉上分开孪晶组分,测定无公度结构的q-矢量。在观看倒易空间时,观看器能提供好多种特征性观看方式,包括观看晶胞和观看每层倒易格子等。对于成功处理最具有挑战性的问题而言,它是一个强有力的工具。它也是进行教学工作的极好工具。
数据收集策略计划编制

    Data collection strategy planning

只要规定了冗余度和您要求您的实验结束的时间,策略计划编制器就能保证您快速得到完整的数据!三斜样品的数据收集会在不到2小时内完成,而要达到指定平均冗余度为4,也只要4.5个小时。


数据比例因子和吸收校正

    Data scaling and absorption correction

支持数字和多重扫描吸收校正。这个插件能提供有用的诊断并能对一些因素造成的偏差进行校正,例如,受照射的晶体体积的变化,入射光束的不均匀性,晶体支撑物造成的吸收,晶体衰变等。它也能改善强度的相对标准偏差(esds)以及剔除外来无关反射点。

因为有这些校正能力,对于反射能力弱的晶体就可以选用较大的晶体颗粒来完成数据收集而不引入系统偏差。

结构求解

    Structure solution

结构求解的SHELXTL方法得到了图形用户界面的支持。该插件对直接法、对偶空间和Patterson方法提供了默认设定值,而且可以选择是否进行结构扩展。



用户能够容易地更改这些默认值。可以很方便地见到统计学结果以及存取相关的文件。这个模块还包括了一个结构观看器,可以很方便地对结构求解的结果进行分析。

结构精修

    Structure refinement

使用强有力和直观的图形用户界面进行结构精修。ModerOpenGL制图法具有展示多个分子的模式,可连接到XL并可进行无序集团精修,具有添加各种约束条件的功能以及其它许多先进的有特色的精修功能。


伪旋进照相

    Pseudo Precession photograph

这个插件可以从一套完整数据逐个像素地重建伪旋进照相的照片。这就能够把热扩散散射,无公度结构,孪晶,以及在倒易空间中正等待您去发现的所有问题都形象化地显现出来了。


自动解结构的软件Autostructure

    Autostructure

AutoStructure 软件能够自动化地进行结构测定,又快又可靠。您可以把它想象为您身边的一位有经验的晶体学家,知道晶体结构求解和精修的所有窍门。 AutoStructure为合成化学家和晶体学新手打开了晶体学领域的大门,使他们能够快速和可靠地进行结构测定。


相位鉴别插件

    Phase ID plugin

这个模块的作用是:把来自不同同心圆层的粉末衍射画面结合起来,形成一个集成的图像。把二维的粉末衍射图像做积分,可以得到更高的计数统计学结果(XRD2),也便于对粉末和单晶衍射谱图进行比较。

用输出工具把积分结果送到布鲁克的DIFFRACplus完整序列软件中去,可以进行进一步的处理。 http://www.bruker-axs.de/index.php?id=22&L=3
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