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gxsulong至尊木虫 (著名写手)
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[交流]
怎样找出蛋白质的三维结构图！
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| 我现在知道一个基因的氨基酸序列，怎样找出其三维结构图，最好能和与其氨基酸序列同源性高的三维结构图一起比较。谢谢！ |
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gxsulong
至尊木虫 (著名写手)
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同源建模的步骤
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lwf991229(金币+2,VIP+0):感谢提供帮助~~
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从待测蛋白质序列出发，搜索蛋白质结构数据库（如PDB,SWISS-PROT等）， 得到许多相似序列（同源序列），选定其中一个（或几个）作为待测蛋白质序列的模板； 待测蛋白质序列与选定的模板进行再次比对，插入各种可能的空位使两者的保守位置尽量对齐； 建模：调整待测蛋白序列中主链各个原子的位置，产生与模板相同或相似的空间结构——待测蛋白质空间结构模型； 利用能量最小化原理，使待测蛋白质侧链基团处于能量最小的位置。 最后，程序提供给用户的是经过如上四步（或重复其中某几步）后得到的蛋白质三级结构。 |
3楼2008-11-11 22:49:23
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