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ckg

木虫 (著名写手)

[求助] 超分子化合物优化过程中客体分子变形,合理吗?

我在计算一个包合物体系,客体分子与环糊精形成超分子化合物,通过分层计算B3LYP/6-31G方法优化后,客体分子进入环糊精空腔前后发生了很明显的分子结构变形,这样的变化是否合理?望高手指点迷津!
如图所示:

超分子化合物优化过程中客体分子变形,合理吗?
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超分子化合物优化过程中客体分子变形,合理吗?-1
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超分子化合物优化过程中客体分子变形,合理吗?-2
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To_strive,to_seek,to_find,and_not_to_yield.
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liji3b109

新虫 (小有名气)

2楼2016-07-17 10:03:32
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xiaochong98

木虫 (职业作家)

北京人
3楼2016-07-17 14:50:06
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小四黑906

铜虫 (正式写手)

正常,构型趋相于能量低的状态

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-07-18 08:33:05
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ckg

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaochong98 at 2016-07-17 14:50:06
能谈谈是如何算的吗

是用高斯软件算的,分层法,ONIOM基组
To_strive,to_seek,to_find,and_not_to_yield.
5楼2016-07-18 08:41:28
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ckg

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 小四黑906 at 2016-07-18 08:33:05
正常,构型趋相于能量低的状态

哦,那现实中的分子也能变形吗?
To_strive,to_seek,to_find,and_not_to_yield.
6楼2016-07-18 08:41:46
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