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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 土壤总DNA提取的用途..........
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seven9870

新虫 (小有名气)

[求助] 土壤总DNA提取的用途.......... 已有3人参与

本人刚接触分子生物学，有很多不明白的地方，希望各位大神指教：
1、老师让从土壤中提取总DNA，提取了之后跑电泳只有一个条带，是正常的吗？
     我原本以为，土壤中有很多微生物，每个微生物的DNA都不一样，那么应该有很多碱基不同的条带？
2、提取了总DNA之后，可以用来做什么分析呢？
     比如可以通过它分析土壤中微生物的多样性吗？还是能做什么其他用途？
   
希望学分子的同学能帮忙指点一下，非常感谢！
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1楼 2016-07-16 12:23:56
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-07-16 22:09:24
seven9870: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-10 08:30:28
1.基因组片段比较大，超过了普通琼脂糖凝胶的分离范围，所以即使大小不同电泳后也只有一条带。
2.总DNA可以用来做宏基因组测序，可以分析土壤中微生物多样性。
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2楼2016-07-16 18:19:46
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star013

新虫 (知名作家)
我们可以帮您做土壤微生物多样性分析

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3楼2016-07-16 18:59:23
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seven9870

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-07-16 18:19:46
1.基因组片段比较大，超过了普通琼脂糖凝胶的分离范围，所以即使大小不同电泳后也只有一条带。
2.总DNA可以用来做宏基因组测序，可以分析土壤中微生物多样性。

太感谢了！
但是还有一点不明白，为什么基因组的片段比较大呢？它是所有DNA连接起来的一条吗？不同物种的DNA可以连接的吗？
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4楼2016-07-16 19:18:54
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by seven9870 at 2016-07-16 19:18:54
太感谢了！
但是还有一点不明白，为什么基因组的片段比较大呢？它是所有DNA连接起来的一条吗？不同物种的DNA可以连接的吗？...

你找本分子生物学书看看基因组那一节内容

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5楼2016-07-17 02:12:28
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
seven9870: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-08-10 08:30:17
1.一个条带确实是marker分辨力的关系，即1mbp和3mbp都只显示成一个条带。
2. 提取土壤总DNA可以对土壤的不可培养微生物进行分子生物学鉴定和研究，方法有16s rRNA测序与物种分型，遗传探针法等。有兴趣的话可以看下这篇文献《土壤微生物总DNA的提取和纯化》（微生物学报，2003）.文中的参考文献1~4讲得比较详细。
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需要金币
6楼2016-07-20 17:12:46
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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
seven9870: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-10 08:30:08
提了总DNA后，可以扩增里面的片段如16S V4-V5区，之后构建文库，利用高通量测序仪器来检测这段区域的序列！之后通过生物信息分析，可以分析微生物的多样性哈！
提DNA是微生物多样性分析第一步！
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专注微生物多样性分析QQ2758452825
7楼2016-08-03 14:34:24
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陈皮柚糖

新虫 (小有名气)
楼主，求助！我也再提土壤的DNA，提取之后电泳没结果。请问你提DNA的方法，还有你凝胶配的多少的。marker是多大的？

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8楼2016-09-21 01:36:14
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