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seven9870

新虫 (小有名气)

[求助] 土壤总DNA提取的用途.......... 已有3人参与

本人刚接触分子生物学,有很多不明白的地方,希望各位大神指教:
1、老师让从土壤中提取总DNA,提取了之后跑电泳只有一个条带,是正常的吗?
     我原本以为,土壤中有很多微生物,每个微生物的DNA都不一样,那么应该有很多碱基不同的条带?
2、提取了总DNA之后,可以用来做什么分析呢?
     比如可以通过它分析土壤中微生物的多样性吗?还是能做什么其他用途?
   
希望学分子的同学能帮忙指点一下,非常感谢!
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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
seven9870: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-10 08:30:08
提了总DNA后,可以扩增里面的片段如16S V4-V5区,之后构建文库,利用高通量测序仪器来检测这段区域的序列!之后通过生物信息分析,可以分析微生物的多样性哈!
提DNA是微生物多样性分析第一步!
专注微生物多样性分析QQ2758452825
7楼2016-08-03 14:34:24
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-07-16 22:09:24
seven9870: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-10 08:30:28
1.基因组片段比较大,超过了普通琼脂糖凝胶的分离范围,所以即使大小不同电泳后也只有一条带。
2.总DNA可以用来做宏基因组测序,可以分析土壤中微生物多样性。
2楼2016-07-16 18:19:46
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以帮您做土壤微生物多样性分析

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-16 18:59:23
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seven9870

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-07-16 18:19:46
1.基因组片段比较大,超过了普通琼脂糖凝胶的分离范围,所以即使大小不同电泳后也只有一条带。
2.总DNA可以用来做宏基因组测序,可以分析土壤中微生物多样性。

太感谢了!
但是还有一点不明白,为什么基因组的片段比较大呢?它是所有DNA连接起来的一条吗?不同物种的DNA可以连接的吗?
4楼2016-07-16 19:18:54
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