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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

[求助] Bonds defined but no bond types 已有1人参与

在读入两个data文件时,总是在读第二个data文件时出现“Bonds defined but no bond types”,但如果把这个data文件单独拿出来在in文件中编写读入,是可以读的,这是怎么回事呢??求大神帮助

Bonds defined but no bond types
2016-07-15 09:32:55屏幕截图.png
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
data文件里写了bond,但是在前面没有定义bond types吧
gromacs
2楼2016-07-18 00:23:34
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2016-07-18 00:23:34
data文件里写了bond,但是在前面没有定义bond types吧

但这bond type是怎么定义的?用bond_style?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-18 08:58:07
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shijunqin

木虫 (小有名气)

在in文件中atom类型后面用bond_stystyle定义键类型即可

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-07-18 12:35:45
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fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-07-18 08:58:07
但这bond type是怎么定义的?用bond_style?
...

bond types和bond coeffs
gromacs
5楼2016-07-19 14:13:49
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by shijunqin at 2016-07-18 12:35:45
在in文件中atom类型后面用bond_stystyle定义键类型即可

我用bond_style定义过,也是这个错误提示

发自小木虫Android客户端
6楼2016-07-20 16:03:19
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by fangsteel at 2016-07-19 14:13:49
bond types和bond coeffs...

bond types?有这个命令吗?

发自小木虫Android客户端
7楼2016-07-20 16:03:46
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