24小时热门版块排行榜    

查看: 1782  |  回复: 6

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

[求助] Bonds defined but no bond types 已有1人参与

在读入两个data文件时,总是在读第二个data文件时出现“Bonds defined but no bond types”,但如果把这个data文件单独拿出来在in文件中编写读入,是可以读的,这是怎么回事呢??求大神帮助

Bonds defined but no bond types
2016-07-15 09:32:55屏幕截图.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
data文件里写了bond,但是在前面没有定义bond types吧
gromacs
2楼2016-07-18 00:23:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fangsteel at 2016-07-18 00:23:34
data文件里写了bond,但是在前面没有定义bond types吧

但这bond type是怎么定义的?用bond_style?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-18 08:58:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shijunqin

木虫 (小有名气)

在in文件中atom类型后面用bond_stystyle定义键类型即可

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-07-18 12:35:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fangsteel

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-07-18 08:58:07
但这bond type是怎么定义的?用bond_style?
...

bond types和bond coeffs
gromacs
5楼2016-07-19 14:13:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by shijunqin at 2016-07-18 12:35:45
在in文件中atom类型后面用bond_stystyle定义键类型即可

我用bond_style定义过,也是这个错误提示

发自小木虫Android客户端
6楼2016-07-20 16:03:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by fangsteel at 2016-07-19 14:13:49
bond types和bond coeffs...

bond types?有这个命令吗?

发自小木虫Android客户端
7楼2016-07-20 16:03:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 胜利笑哈哈 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +3 18419759900 2026-03-25 3/150 2026-03-25 23:20 by peike
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] 275求调剂 +3 Micky11223 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:32 by barlinike
[考研] 289求调剂 +14 硕星赴 2026-03-23 14/700 2026-03-25 22:22 by 544594351
[考研] 招08考数学 +8 laoshidan 2026-03-20 17/850 2026-03-25 17:52 by 一个红太阳
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 289求调剂 +9 怀瑾握瑜l 2026-03-20 9/450 2026-03-25 11:02 by userper
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 一志愿中南化学(0703)总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 求调剂 +3 @taotao 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:35 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
信息提示
请填处理意见