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bucthe

金虫 (初入文坛)

[求助] 关于bader分析出错 已有1人参与

请教各位高手,我在做bader电荷分析的时候,出现了如图情况:
1.分析过程很快,也就是1s的时间,但是我的体系很大,有226个原子,按理说每一步分析的时候,进程百分比都很慢才对;
2.每一步进程百分比都是没有走完就下一步了;
3.提示说我的网格是0x0x0,但是我的KP明明是5x5x1;
4.最后查看ACF文档的时候,charge 和 min dist都为0,而且原子数也不对,ACF里面给出的原子数才127个;
忘各位前辈不吝赐教!

关于bader分析出错
图片1.png


关于bader分析出错-1
图片2.png
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车道山前必有路~
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bucthe

金虫 (初入文坛)

自己顶一下,希望有人能帮忙解决!
车道山前必有路~
2楼2016-07-14 12:06:05
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朱全喜

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bucthe at 2016-07-14 12:06:05
自己顶一下,希望有人能帮忙解决!

你先把用于处理BADER分析的源文件,也就是编译之前的.f文件打开贴出来我看看,很可能是原子数目超出了脚本中定义的上限因而需要修改。

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-15 06:01:43
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朱全喜

新虫 (小有名气)

还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-07-15 06:08:47
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bucthe

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:08:47
还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗?

之前的准备文件应该都没问题,我之前做个很多次bader都没错,就这次估计体系太大了就出问题了。
车道山前必有路~
5楼2016-07-15 20:03:28
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bucthe

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:01:43
你先把用于处理BADER分析的源文件,也就是编译之前的.f文件打开贴出来我看看,很可能是原子数目超出了脚本中定义的上限因而需要修改。
...

您好!我不太理解您说的“编译之前的.f文件”是什么意思,在我们服务器上就只有bader这个脚本,我本身对脚本的编译不是很懂,麻烦您能给个截图看看是什么吗?谢谢了!
车道山前必有路~
6楼2016-07-15 20:07:14
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朱全喜

新虫 (小有名气)

我现在在外面用手机上网不太方便,其实我说的就是编译之前的fortran文件

发自小木虫Android客户端
7楼2016-07-15 21:45:22
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cxycxu

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:08:47
还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗?

怎么看对不对呢
8楼2017-01-05 14:19:26
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cxycxu

新虫 (初入文坛)

我遇到了同样的问题
但是我原子数比较少,才117个原子 ,但是也是进行不下去,做60几个的时候明明还好好的,请问你最后解决了么
9楼2017-01-05 14:20:34
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朱全喜

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by cxycxu at 2017-01-05 14:20:34
我遇到了同样的问题
但是我原子数比较少,才117个原子 ,但是也是进行不下去,做60几个的时候明明还好好的,请问你最后解决了么

你把CHARGCAR_sum文件的开头一部分截屏贴出来看看

发自小木虫Android客户端
10楼2017-01-05 20:10:07
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