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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于bader分析出错
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bucthe

金虫 (初入文坛)

[求助] 关于bader分析出错 已有1人参与

请教各位高手，我在做bader电荷分析的时候，出现了如图情况：
1.分析过程很快，也就是1s的时间，但是我的体系很大，有226个原子，按理说每一步分析的时候，进程百分比都很慢才对；
2.每一步进程百分比都是没有走完就下一步了；
3.提示说我的网格是0x0x0，但是我的KP明明是5x5x1；
4.最后查看ACF文档的时候，charge 和 min dist都为0，而且原子数也不对，ACF里面给出的原子数才127个；
忘各位前辈不吝赐教！

关于bader分析出错
图片1.png


关于bader分析出错-1
图片2.png
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车道山前必有路~
1楼 2016-07-12 23:17:10
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bucthe

金虫 (初入文坛)
自己顶一下，希望有人能帮忙解决！
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车道山前必有路~
2楼2016-07-14 12:06:05
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朱全喜

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bucthe at 2016-07-14 12:06:05
自己顶一下，希望有人能帮忙解决！

你先把用于处理BADER分析的源文件，也就是编译之前的.f文件打开贴出来我看看，很可能是原子数目超出了脚本中定义的上限因而需要修改。

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3楼2016-07-15 06:01:43
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朱全喜

新虫 (小有名气)
还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗？

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4楼2016-07-15 06:08:47
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bucthe

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:08:47
还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗？

之前的准备文件应该都没问题，我之前做个很多次bader都没错，就这次估计体系太大了就出问题了。
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车道山前必有路~
5楼2016-07-15 20:03:28
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bucthe

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:01:43
你先把用于处理BADER分析的源文件，也就是编译之前的.f文件打开贴出来我看看，很可能是原子数目超出了脚本中定义的上限因而需要修改。
...

您好！我不太理解您说的“编译之前的.f文件”是什么意思，在我们服务器上就只有bader这个脚本，我本身对脚本的编译不是很懂，麻烦您能给个截图看看是什么吗？谢谢了！
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车道山前必有路~
6楼2016-07-15 20:07:14
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朱全喜

新虫 (小有名气)
我现在在外面用手机上网不太方便，其实我说的就是编译之前的fortran文件

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7楼2016-07-15 21:45:22
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cxycxu

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 朱全喜 at 2016-07-15 06:08:47
还有就是你在做BADER分析之前的准备文件CHARG_SUM搞对了吗？

怎么看对不对呢
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8楼2017-01-05 14:19:26
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cxycxu

新虫 (初入文坛)
我遇到了同样的问题
但是我原子数比较少，才117个原子 ，但是也是进行不下去，做60几个的时候明明还好好的，请问你最后解决了么
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9楼2017-01-05 14:20:34
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朱全喜

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by cxycxu at 2017-01-05 14:20:34
我遇到了同样的问题
但是我原子数比较少，才117个原子 ，但是也是进行不下去，做60几个的时候明明还好好的，请问你最后解决了么

你把CHARGCAR_sum文件的开头一部分截屏贴出来看看

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10楼2017-01-05 20:10:07
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