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wt326

新虫 (初入文坛)

[交流] PCR产物能直接用于酶切吗? 已有9人参与

本人提取一个复合菌群的基因组DNA, 想做多样性分析。 初步想用16S rDNA 扩增的PCR产物直接酶切可以吗? 需要注意什么呢? 酶为Msp I 和 Afa I
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ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-07-12 14:59:39
PCR产物纯化之后可以做酶切,但是用16S rDNA 扩增的PCR产物直接酶切做多样性分析,效果可能不好,现在都不用这个了。最好是做高通量测序,这样分析的意义大些。
一品黄山
2楼2016-07-12 11:38:38
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flhua

木虫 (正式写手)

bachelordom


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
纯化好就可以没切吧 做高通量测序分析比较高大上一点 价钱也不会太贵
只要有梦想,坚持就一定能实现
3楼2016-07-12 12:32:57
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cm14704019

至尊木虫 (知名作家)

4楼2016-07-13 08:07:31
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1135482512

铁杆木虫 (著名写手)


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我做植物的,PCR产物直接酶切没问题

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5楼2016-07-13 09:16:23
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scofield111

银虫 (正式写手)

6楼2016-07-13 11:52:50
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娟恋幸福

新虫 (小有名气)


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可以,不过我一般都酶切过夜

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7楼2016-07-13 12:36:29
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一笑中

铜虫 (正式写手)


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看你酶切的量了,太多的化会引起酶切条件下盐离子的改变,会造成酶切效率低,没有别的影响

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8楼2016-07-13 16:36:42
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18242016312

新虫 (小有名气)


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提总DNA后直接送去测序,大约500一个样品。多样性结果就有了

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9楼2016-07-13 23:52:41
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丹丹的小橙子

新虫 (初入文坛)


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纯化后酶切吧,我每次都这样,虽然麻烦,但是不会出问题

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10楼2016-07-14 02:24:30
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