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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » sybyl最佳主成分数
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琥珀-hyn

新虫 (小有名气)

[求助] sybyl最佳主成分数 已有1人参与

化合物样本数有16个进行COMFA模型建立，当进行PLS分析时交叉验证得出的最佳主分成数是7会不会太大了，之前看过文献说二维的化合物比去结构参数要大于等于5，按这样的话7是过大。有对这方面熟悉的同志们，能否帮忙回答吗？谢谢
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1楼 2016-07-10 16:54:23
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琥珀-hyn

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 程小咬 at 2016-07-11 12:19:35
还可以吧。。。现在不都就行3D嘛。。。

谢谢
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3楼2016-07-11 23:32:42
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程小咬

禁虫 (正式写手)
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琥珀-hyn
2楼2016-07-11 12:19:35
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tripos

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

一般主成分数在样本数的1/3~1/5之间比较合理，LZ只有16个样本的话，主成分数在3~6之间为宜，7的话略高，可能过拟合。
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4楼2016-08-10 09:26:50
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haochunzhi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by tripos at 2016-08-10 09:26:50
一般主成分数在样本数的1/3~1/5之间比较合理，LZ只有16个样本的话，主成分数在3~6之间为宜，7的话略高，可能过拟合。

请问用训练集的模型去预测测试集的分子活性，为什么5个测试分子都是一个活性值呢？求大神指导
赞一下 回复此楼
5楼2017-06-04 20:07:09
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