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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 为什么NCBI和UCSC调出的序列会不一样但是却100%匹配呢
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kuaile5420

专家顾问 (著名写手)

[求助] 为什么NCBI和UCSC调出的序列会不一样但是却100%匹配呢 已有2人参与

最近在查找一个基因的序列，根据染色体的位置在UCSC和NCBI中分别调出该序列，但是观察发现前面的一些碱基都不是完全匹配的，可是在NCBI将两序列进行Blast，发现竟然100%匹配，而且NCBI中的序列信息变得和UCSC一样的，很奇怪是为什么？推测是基于的Genome测序版本不一样导致的？UCSC选择的是Dec.2013(GRCh38/hg38),NCBI现在是那个版本呢？万分感谢！！
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坚持到底就是胜利！
1楼 2016-07-08 11:11:47
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seeker91

木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香，谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利，文章多多。 2016-07-08 15:58:39
kuaile5420: 金币+3, ★有帮助 2016-08-04 13:29:42
还有另外一个名字呗，一个基因，会有多个名字，或者查查氨基酸序列就更确定了。
祝福祝福
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2楼2016-07-08 11:45:56
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香，谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利，文章多多。 2016-07-08 15:58:48
kuaile5420: 金币+4, ★★★很有帮助 2016-08-04 13:29:12
不会是正义链、反义链的问题吧，网站比对时，同时搜索双链。
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3楼2016-07-08 14:37:53
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ygidtu

新虫 (正式写手)
版本一般不会影响到这个把。一般用的是hg19,hg38,我觉着你可以看一下外显子内含子的问题，有可能是两者边缘模糊，或者是什么亚型直接的

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4楼2016-07-09 11:08:50
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