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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

[求助] SMART预测蛋白质结构

TOLL样受体预测蛋白质结构，SMART由于threshold不显示LRR区域。
我想要显示LRR的图片，求怎么办？ LRR Finder显示有LRR，但是没有图片。
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1楼 2016-07-02 13:56:46
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气
SMART那个图
说实话难看的要死，还分辨率低
按照大概范围自己用PPT来画要好很多
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Let God do with it as He wills
2楼2016-07-03 01:22:49
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2016-07-03 01:22:49
SMART那个图
说实话难看的要死，还分辨率低
按照大概范围自己用PPT来画要好很多

有没有这种情况，SMART预测的LRR很少或者没有，但是用别的软件LRR Finder就有，那该如何作图呢？

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3楼2016-07-03 12:16:54
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)
我在别的文献看到别人描述自己的有很多个LRR，但是我把他的蛋白序列用SMART预测，并没有那么多。这是个什么情况？！？！

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4楼2016-07-04 01:29:49
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zhangjie2005

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 凯伦爱佳佳 at 2016-07-04 01:29:49
我在别的文献看到别人描述自己的有很多个LRR，但是我把他的蛋白序列用SMART预测，并没有那么多。这是个什么情况？！？！

不知道你这个问题最后是怎么解决的？
我看到预测很多的是另一种方法，参考文献Matsushima N, Tanaka T, Enkhbayar P, et al. Comparative sequence analysis of leucine-rich repeats (LRRs) within vertebrate toll-like receptors[J]. BMC genomics, 2007, 8(1): 1.
但是我看的不是太明白，相关预测网站也打不开，如果你已经解决了此问题，希望能指点一下，谢谢！
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5楼2016-11-26 18:21:10
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