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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 3,RACE结果如何获得CDS区? 已有1人参与

到polyA代表啥?
之后是啥?
CDS怎么判断

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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

2楼2016-07-02 20:33:23
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

3楼2016-07-04 23:57:09
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jackyoung

新虫 (正式写手)

CDS怎么判断是个问题,一般可以通过同源基因、同家族的蛋白序列等来获取辅助信息(限于没有研究过的情况),如果直接有人提交过序列,那就可以通过预测得出,
polyA是真核生物Pol II转录的特征序列,在终止子区域(识别polyA信号后)加上一定长度的A,起到保护成熟mRNA的作用。

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CestLaVie
4楼2016-07-05 08:19:00
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

没有序列可以比对,是不是用ORFfinder预测?

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5楼2016-07-05 08:24:27
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

6楼2016-07-05 22:22:51
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以提供race技术服务

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7楼2016-07-06 08:10:07
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水杯小一

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by yuguiyan at 2016-07-05 08:24:27
没有序列可以比对,是不是用ORFfinder预测?

如果polyA已经有了,可以直接用orffinder看看CDS,最连贯的那条一般是CDS
8楼2016-07-06 17:42:05
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 水杯小一 at 2016-07-06 17:42:05
如果polyA已经有了,可以直接用orffinder看看CDS,最连贯的那条一般是CDS...

我得到的这段跟已知的比较,突变了一个碱基

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9楼2016-07-06 18:03:56
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

10楼2016-07-14 21:51:54
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