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金虫 (小有名气)

[求助] 关于分子链构型问题已有1人参与

本人量化新手，最近使用高斯09计算小分子链。不过发现计算有的聚合物分子链时，用GV建立的分子构象在变化。如计算聚酰亚胺（kapton）时，一条分子链包含三个结构单元，构造完后分子链发生弯曲和扭转，不知道那种情况稳定可以计算？可能需要优化。。。

刚开始学，希望大家给予帮助，谢谢！

1楼 2016-06-29 08:39:42

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版主 (著名写手)

感谢参与，应助指数 +1

从聚合物分子链截取三个结构单元时，这三个结构单元两端会有断键，必须在断键处作所谓“封头”，如通常安排一个H原子或者CH3，避免因断键形成单电子使结构变化。封头之后再优化。

2楼2016-06-29 15:33:51

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金虫 (小有名气)

引用回帖:

2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-06-29 15:33:51
从聚合物分子链截取三个结构单元时，这三个结构单元两端会有断键，必须在断键处作所谓“封头”，如通常安排一个H原子或者CH3，避免因断键形成单电子使结构变化。封头之后再优化。

谢谢！这个封头不会影响结果吧～若是计算分子链带电荷时的情况该如何处理？

发自小木虫Android客户端

3楼2016-07-01 07:18:43

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