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amber2076

金虫 (小有名气)

[求助] 关于分子链构型问题 已有1人参与

本人量化新手,最近使用高斯09计算小分子链。不过发现计算有的聚合物分子链时,用GV建立的分子构象在变化。如计算聚酰亚胺(kapton)时,一条分子链包含三个结构单元,构造完后分子链发生弯曲和扭转,不知道那种情况稳定可以计算?可能需要优化。。。

刚开始学,希望大家给予帮助,谢谢!
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amber2076

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2016-06-29 15:33:51
从聚合物分子链截取三个结构单元时,这三个结构单元两端会有断键,必须在断键处作所谓“封头”,如通常安排一个H原子或者CH3,避免因断键形成单电子使结构变化。封头之后再优化。

谢谢!这个封头不会影响结果吧~若是计算分子链带电荷时的情况该如何处理?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-01 07:18:43
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
从聚合物分子链截取三个结构单元时,这三个结构单元两端会有断键,必须在断键处作所谓“封头”,如通常安排一个H原子或者CH3,避免因断键形成单电子使结构变化。封头之后再优化。
2楼2016-06-29 15:33:51
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