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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 简并碱基（引物）
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z631535213

木虫 (正式写手)

[求助] 简并碱基（引物） 已有2人参与

请问下大家关于兼并碱基的一点事。刚发邮件问过某工，回复如图。
比如兼并引物序列为5-AAAAYAAAAAAYAAAAAAA-3
按照回复邮件的意思，对这条兼并引物测序的话那应该就是
5-AAAACAAAAAACAAAAAAA-3
5-AAAACAAAAAATAAAAAAA-3
5-AAAATAAAAAATAAAAAAA-3
5-AAAATAAAAAACAAAAAAA-3
这四种序列？
那和单独合成这四种序列不是没多大区别吗？不知道我这个理解是不是有误啊-.-

简并碱基（引物）
jianbing.jpg
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1楼 2016-06-23 13:30:44
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ssswzf

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香，谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利，文章多多。 2016-06-24 00:04:05
z631535213: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-06-24 21:29:13
首先你说没有问题啊，如果你合成上述的4条引物的话，和5-AAAAYAAAAAAYAAAAAAA-3测序结果理论上是一致的，

5-AAAAYAAAAAAYAAAAAAA-3如果测序的结果有4种可能，
你如果确定合成了ABCD4种引物，分开pcr的话，测序就是一种结果了！
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2楼2016-06-23 13:37:56
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kaobo2012

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香，谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利，文章多多。 2016-06-24 00:04:12
z631535213: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-06-24 21:29:02
楼主，你应该是在建库吧？你的理解是对的，是有四种可能。为什么不分开？简单说，就是减少你的工作量。一般出现简并引物，不仅会在上游，下游引物也会出现。这样组合 是很多的，够你忙活一阵子了，所以就不建议再分开合成了。
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3楼2016-06-23 20:12:41
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