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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯优化模型
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jallent

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】高斯优化模型

请问各位：我优化一个小分子化合物（100多分子量），采用以下的方式，不知和不合理？

%chk=imm1
%mem=500mb
%nproc=2
# opt hf/6-31+g(d) geom=connectivity

不知道6-31g(d), 与6-31+g(d)，6-31++g(d)等基组有什么区别？一般来讲，用HF的方法和用密度泛函的方法优化结构哪个更准确些，刚开始学，很多不动，请各位多指教，谢谢～
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1楼 2008-11-06 21:51:48
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wonderflyer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
灯塔守望者(金币+2,VIP+0):欢迎再来小木虫
jallent(金币+2,VIP+0):谢谢
一般来说，密度泛函方法优化的结构更好，比如，B3LYP和B3PW91，分子不大，基组6-31+g(d，p)合适，既有极化，又有弥散函数。
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2楼2008-11-07 08:38:12
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jallent

木虫 (正式写手)
谢谢楼上，我用HF的方法优化需要的时间差不多要20小时，如果用B3LYP的话估计要更长时间吧？此外想问一下优化出来的结构用什么方式可以看到空间结构？用GAOSSIN VIEW 查看的空间结构好象不准确，比如优化后双键变成单键了，谢谢！
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3楼2008-11-07 15:20:05
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wonderflyer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
jallent(金币+1,VIP+0):xiexie!
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
HF和密度泛函优化，时间差不多，但一般来说，密度泛函更精确。优化的结构可以用GAUSSVIEW看，它只是把结构显示出来，不是不准确，只是它内部默认键长多少是单键，超过这个值就显示为双键。具体的构型看优化结果文件或直接从GAUSSVIEW读出你需要的构型数据，比如C-O键长等。
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4楼2008-11-07 16:29:52
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jallent

木虫 (正式写手)
谢谢啊，可是比如我要放在文章里面，那结构如果本来是双键显示成单键的话那别人肯定会质疑啊？
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5楼2008-11-07 17:26:43
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wonderflyer

木虫 (正式写手)
★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
我认为审稿人应该清楚你提供的结构为什么会显示成单键，你要不放心可以把键长标示出来或者直接在GAUSSVIEW中把该键用双键表示就行了。
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6楼2008-11-08 09:32:08
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kele1982

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
jallent(金币+2,VIP+0):谢谢
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
当然是密度泛函的方法会准确些，特别使计算振动频率FREQ的时候，采用密度泛函的方法所得到的结果基本接近实验植，因为其修正系数基本接近1，HF的方法修正系数0.8-0.9之间。不过如果你的分子量比较大或者含有较多杂原子如P，S等，还是建议用HF方法，不然计算时间会比较长。
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踏上科研不归路！
7楼2008-11-09 10:10:00
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