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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps做分子动力学模拟的工作站配置指导
汕头大学海洋科学接受调剂
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悸末

铜虫 (初入文坛)

[求助] lammps做分子动力学模拟的工作站配置指导 已有1人参与

导师想配一个工作站，主要是ubuntu 14.04下预装lammps做分子动力学模拟。模拟的原子数有几百万个。目前预算在三万以内。各位能给个差不多的配置供参考吗？三万以内能配个GPU 加速计算的吗？谢谢
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1楼 2016-06-22 16:07:24
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DeepLearning

禁言 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
4楼2016-07-22 15:36:15
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
悸末: 金币+5, ★有帮助 2016-06-23 09:16:29
三万以内很难配好的gpu工作站。比如，k20估计要一万多一块，但显存只有5个G左右。k40的显存有12G，但估计要两万多一块。所以，大概要五六万预算。如果你用Geforce系列，三万都可以配到很高端的titan卡，但我觉得搞研究还是用tesla系列的保险。我曾经用gefoce系列的卡得到无法理解的错误结果。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2016-06-22 18:14:40
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xiaomir

木虫 (小有名气)
如果认真的用GPU的话，GPU本身的费用就在一万上下。LAMMPS的GPU技术现在其实不太成熟，我觉得没有必要追求这个。MD模拟事实上并不是很费时间。
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3楼2016-06-27 17:14:29
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732CHFchf

新虫 (初入文坛)
您好。看到你有使用GPU加速计算，真的瞬间让我看到曙光了。这几天在编译安装基于GPU的lammps。最后make gpu时总是报错。不知道是否恳请您给予指导？是否有教程供参考？非常感谢。恳请您出手相救。
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5楼2016-10-08 18:50:52
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