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raopian

新虫 (初入文坛)

[求助] 转基因植物检测如何排除农杆菌干扰,或者提供其他思路~~

是这样的,转基因的抗性植物提取DNA后,但是由于农杆菌没有脱干净,基因组DNA中可能是带质粒DNA的,用通用引物PCR检测的时候,所有的样本DNA都能P到目的条带,所以就没办法检测了。我试过做切胶回收了,但是没有什么分离效果,所有的DNA依然能够P出产物~~so,有大神能够提供一点方法去分开农杆菌干扰么,除去质粒DNA,或者其他的检测方法之类的~~~对了,我的载体没有荧光蛋白或者GUS。。。。。。
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Neo2000

木虫 (著名写手)

你干嘛纠结这个问题,后面不是还有RNA和蛋白可以检测吗?

发自小木虫Android客户端
4楼2016-06-23 20:10:33
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M1182

版主 (文坛精英)

聪聪家族

优秀版主

这个问题不好说,也有可能是你引物的问题。你的阳性对照和阴性对照都有吗?
2楼2016-06-21 22:05:48
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raopian

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by M1182 at 2016-06-21 22:05:48
这个问题不好说,也有可能是你引物的问题。你的阳性对照和阴性对照都有吗?

做了阴性对照,没有,,阳性的木有做~~引物没有问题应该,前面所用的菌检测的时候都正常~~~
3楼2016-06-23 18:59:53
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raopian

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Neo2000 at 2016-06-23 20:10:33
你干嘛纠结这个问题,后面不是还有RNA和蛋白可以检测吗?

并没有,我做删除~~只能说对靶点测序,但是这样的话每个样本都要克隆测序了~~~先用通用方法可以筛一遍~~而且载体转进去了也不一定靶点有变化~~所以要先确定是不是转进去了
5楼2016-06-24 09:23:18
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