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诸葛莫莫

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 关于Olex软件分析分子间氢键的问题 已有1人参与

请教各位大神,在分析氢键时是直接在Olex软件里面有工具标出吗?我的结构在Olex软件里面未显示氢键作用,但是酰胺键(N-H)的H与羰基的O之间距离为2.6 埃,文献支持是存在氢键的,但不知道这样的距离在晶体里面说氢键合不合理?谢谢!
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2楼2016-06-20 09:40:30
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诸葛莫莫

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lich666 at 2016-06-20 09:40:30
距离有点远,作用比较弱,可算可不算的。
重点讨论强的氢键,弱的看情况。

您好!谢谢您的回复。那您认为在晶体结构中如果存在强的氢键距离最大不应该超过多少呢?文献上面报道的是酰胺键(N-H)的H与羰基的O之间距离形成氢键距离最大不应该超过3.2 埃。按照这个说法我的这个分子是存在氢键的,毕竟他们的距离是2.6 埃,要小于3.2 埃。我现在想知道晶体结构中是不是对氢键的距离要求更严格?谢谢您!
3楼2016-06-20 10:38:37
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4楼2016-06-20 11:02:35
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