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华音流韶

新虫 (初入文坛)

[求助] 连载体菌p相关问题 已有1人参与

在做三个基因的克隆,一起做的,第一个基因摇菌完做菌p出来的条带总是载体序列,但是第二个和第三个是正确的,这是载体自连吗?已经两次了。
附图,最左边是dl2000maker,然后每九个孔是一个基因,中间空一格

连载体菌p相关问题


@biostar2009 @飞约疯人院 发自小木虫IOS客户端
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2016-06-20 07:38:24
xn8008: 应助指数+1 2016-06-20 07:59:53
1) 你怎么确定是载体自连?没有测序光看大小不能说明问题
2) 用什么引物做的PCR,一般用克隆引物来做,这样有条带就是连入(除去污染情况),无就是没有。
3) 用通用引物也行,但基本都会P出条带,调与你连入大小相似的菌株提质粒、酶切再鉴定。

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Let God do with it as He wills
2楼2016-06-20 05:22:03
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华音流韶

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by atlanticwi at 2016-06-20 05:22:03
1) 你怎么确定是载体自连?没有测序光看大小不能说明问题
2) 用什么引物做的PCR,一般用克隆引物来做,这样有条带就是连入(除去污染情况),无就是没有。
3) 用通用引物也行,但基本都会P出条带,调与你连入大小 ...

测序过了,测出来的结果在Ncbi上比对就是pmd19t载体序列,引物就是根据序列设计的普通引物啊,关键这三个基因是一起做的,就第一个有问题,其他两个都测出来了……

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3楼2016-06-20 10:01:24
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mlxmiao

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 华音流韶 at 2016-06-20 10:01:24
测序过了,测出来的结果在Ncbi上比对就是pmd19t载体序列,引物就是根据序列设计的普通引物啊,关键这三个基因是一起做的,就第一个有问题,其他两个都测出来了……
...

全部用载体上的通用引物来检测,比如说M13。最好不要用基因引物。然后根据大小来选择测序

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4楼2016-06-20 10:09:56
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华音流韶

新虫 (初入文坛)

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引用回帖:
4楼: Originally posted by mlxmiao at 2016-06-20 10:09:56
全部用载体上的通用引物来检测,比如说M13。最好不要用基因引物。然后根据大小来选择测序
...

我试试,谢谢噢

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5楼2016-06-20 10:23:47
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