| 查看: 4149 | 回复: 14 | ||
周先森回家了金虫 (著名写手)
|
[求助]
过渡态计算，nebresults.pl后，vaspgr里面的几个eps都是0啊 具体见图 已有1人参与
|
如题目中描述， 第一个图是vaspgr里面的几个文件 ，第二个图是Linux下的报错命令，我个人觉得是vtstscripts中的vef.gnu有问题 ，第三个图是vef.gnu的内容，，希望遇到过此类问题或者是明白其中原因的大神，能给指点一二，不胜感激。 1.png  2.png  3.png |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有3人回复
-
基金不中，共勉
已经有4人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有5人回复
-
我不理解！
已经有23人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有10人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
-
怎么查啊
已经有5人回复
-
范进中举一文的中心思想
已经有10人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有25人回复
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
周先森回家了: 金币+5 2016-11-25 21:43:07
感谢参与，应助指数 +1
周先森回家了: 金币+5 2016-11-25 21:43:07
|
你直接运行‘nebconverge.pl’，然后再检查01, 02, ....目录下fe.dat文件里的内容，可能这个文件里根本没有数据。 如果没有数据的话，那问题就就是检查nebconverge.pl有问题了，它没有产生fe.da文件。至于为什么没有产生fe.dat文件，那得细查了。 在01目录逐一运行如下命令 gzip -d OUTCAR.gz grep 'FORCES: m' OUTCAR` grep 'energy w' OUTCAR 看有没有在屏幕上打印出力和能量相关的数据。 如果没有的话，那你的OUTCAR有问题。 如果有的话，那可能是nebconverge.pl脚本有点问题，你得到vtst工具的论坛上去问问， 与nebconverge.pl脚本文件里的如下内容有关： $energy=`grep 'energy w' OUTCAR`; $forces=`grep 'FORCES: m' OUTCAR`; @forces = split /\n/ , $forces; @energy = split /\n/ , $energy; 可能是perl版本或者OUTCAR（是vasp4.6或5.x版本）问题有关。 |
2楼2016-06-19 16:13:08
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2016-06-19 16:29:47
周先森回家了
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2520.9
- 散金: 50
- 红花: 6
- 沙发: 3
- 帖子: 1206
- 在线: 193.8小时
- 虫号: 4537422
- 注册: 2016-03-24
- 性别: MM
- 专业: 化学工程及工业化学
|
首先感谢您的应助，我刚学vasp，有下面几个问题不太明白： 1，fe.dat 以及 vaspout.eps 是用来干什么的 2，我计算过渡态有段时间了，算了一段时间，然后02像是过渡态，我就做了频率分析计算，结果有8个虚频。然后我把之前的contcar变为poscar继续计算，算了段时间，觉得还是02过渡态，又对其频率分析计算，还没出结果。如果我重新安装了vtstcode，那之前的计算还是有效的吧，我还可以把contcar变为poscar继续计算吧？不用从头开始计算过渡态吧？ 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-06-19 16:57:13
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2016-06-19 19:39:30
周先森回家了
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2520.9
- 散金: 50
- 红花: 6
- 沙发: 3
- 帖子: 1206
- 在线: 193.8小时
- 虫号: 4537422
- 注册: 2016-03-24
- 性别: MM
- 专业: 化学工程及工业化学
|
我不太懂你说的，我做过渡态用的CI-NEB方法，做过渡态之前，必须往服务器电脑上安装CINEB的插件，把那个CI-NEB文件夹拷到服务器电脑上之后，我看到这个文件夹里面有个vtstcode的文件夹，这是不是就是说是用vtstcode编译的呢？ 发自小木虫Android客户端 |
6楼2016-06-19 19:49:04
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2016-06-20 18:36:57
周先森回家了
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2520.9
- 散金: 50
- 红花: 6
- 沙发: 3
- 帖子: 1206
- 在线: 193.8小时
- 虫号: 4537422
- 注册: 2016-03-24
- 性别: MM
- 专业: 化学工程及工业化学
送红花一朵 |
嗯嗯 好的，谢谢。 我优化完之后，用dist.pl查看了一下，见图。 我这个返回值 是5.83497 大于5埃了 是不是优化的结构不好呀。 我的EDIFFG = -0.01 EDIFF=1E-05 感觉精度也不算低了呀，为什么优化的不行呢  发自小木虫Android客户端 |
8楼2016-06-20 23:03:04
valenhou001
至尊木虫 (职业作家)
- 1ST强帖: 13
- 应助: 241 (大学生)
- 金币: 25701.7
- 散金: 602
- 红花: 166
- 帖子: 3782
- 在线: 873.8小时
- 虫号: 1007127
- 注册: 2010-04-27
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
9楼2016-06-21 08:18:02
周先森回家了
金虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2520.9
- 散金: 50
- 红花: 6
- 沙发: 3
- 帖子: 1206
- 在线: 193.8小时
- 虫号: 4537422
- 注册: 2016-03-24
- 性别: MM
- 专业: 化学工程及工业化学
10楼2016-06-21 08:50:18
