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小李纸11

银虫 (正式写手)

[求助] 不同物种体内同种酶的功能及编码该酶的基因序列相同吗? 已有3人参与

例如给定一个酶(如P450Scc),在原核生物和某种两栖动物中都有编码该酶的基因,但基因序列不同,那表达出的酶是一样的吗?结构、功能什么的?还有,假如真核生物本身有这段基因,那我还需要在它里面导入其他物种的该段基因进行表达吗?如果我想得到这个酶的话?
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小李纸11

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-06-17 01:49:08
你说的这种情况就是同源基因,一般情况下,不同物种中同源基因核酸序列不同,蛋白序列也有差异,但蛋白序列间差异小于核酸序列间的差异,物种间亲缘关系越近其序列间差异性越小。所以表达出的酶是有差异的,结构相似 ...

那请问如果我两段序列BLAST结果为85%它们的差异大吗?大概多少的时候差异才比较小呢?
3楼2016-06-17 08:26:21
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你说的这种情况就是同源基因,一般情况下,不同物种中同源基因核酸序列不同,蛋白序列也有差异,但蛋白序列间差异小于核酸序列间的差异,物种间亲缘关系越近其序列间差异性越小。所以表达出的酶是有差异的,结构相似,功能相同或相似。你想得到特定的酶,肯定是需要用编码该酶的基因去表达。
2楼2016-06-17 01:49:08
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小李纸11: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-07-04 14:04:48
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小李纸11 at 2016-06-17 08:26:21
那请问如果我两段序列BLAST结果为85%它们的差异大吗?大概多少的时候差异才比较小呢?...

85%属于差异很小的。同一种蛋白在不同物种中的编码基因都不相同,但是活性中心一般是保守的。一般同源性大于30%或40%就可以认为是同源性比较近的酶了。
4楼2016-06-17 09:35:43
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小李纸11: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-07-04 14:04:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小李纸11 at 2016-06-17 08:26:21
那请问如果我两段序列BLAST结果为85%它们的差异大吗?大概多少的时候差异才比较小呢?...

差异性大小是个相对概念,一般认为蛋白序列间相似性大于30%,即可视为同源基因,但不同基因家族保守型不同,同样两个物种之间,保守性高的基因相似性可能99%,而保守性低的可能只有60%,这个要看具体基因而定。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2016-06-17 10:37:50
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