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tranquil1993

新虫 (初入文坛)

[求助] 液滴质心约束 已有2人参与

模拟双液滴，在做NVT的时候，两个水滴的质心位置发生偏移，与主方向错开，请问如何使这两个液滴的质心约束在其原来位置？（不是对所有分子在Y,Z方向进行约束，而允许X方向运动）
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1楼 2016-06-16 11:02:05
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
轻微的波动时可能的，应该不会错开吧！你的两个也低的分子个数大约多少？
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2楼2016-06-18 08:55:22
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yangdongjiao

新虫 (小有名气)
楼主你好，我想问一下你用的是MS软件吗、用的是什么模块构建水滴、我是初学者，谢谢赐教
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3楼2016-06-20 08:52:22
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tranquil1993

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2016-06-18 08:55:22
轻微的波动时可能的，应该不会错开吧！你的两个也低的分子个数大约多少？

5000

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4楼2016-06-20 14:33:23
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tranquil1993

新虫 (初入文坛)
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5楼2016-06-21 12:31:43
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yangdongjiao

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by tranquil1993 at 2016-06-21 12:31:43
Packmol
...

哦，谢谢了*^_^*

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6楼2016-06-22 08:43:36
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zhangduo2016

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主，请问你找到如何固定质心的方法了吗？我想把我小分子配体质心固定，求助
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7楼2018-01-28 20:33:28
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cm小陈

新虫 (初入文坛)
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8楼2018-01-29 13:50:04
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