24小时热门版块排行榜    

查看: 7412  |  回复: 1

mystao

新虫 (初入文坛)

[求助] 差异分析时,基因foldchange很大,但是统计学不显著

在用二代测序数据fpkm或者readcounts进行差异分析的时候,基因的表达丰度并不低的情况下,为什么会出现基因foldchange很大,但是统计学不显著p值不显著的情况?,统计学显著性理论上就是检验表达差异性的,foldchange差异很大的情况,p-value应该很小才对,求解,谢谢!!举例如下(cuffdiff 结果,DESeq也有类似情况):
transcript_id                         gene_id                               gene_name gene_location                     KO_FPKM  WT_FPKM  log2(foldchange)  pvalue   qvalue
ENSMUST00000115118  ENSMUSG00000031095  Cul4b           chrX:38533273-38576196   2.01117  10.7411      -2.41703             0.07125  0.999514
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfy535251

新虫 (小有名气)

您好,我想问下你这个log2FC是怎么算出来的

发自小木虫Android客户端
2楼2016-11-25 19:25:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mystao 的主题更新
信息提示
请填处理意见