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差异分析时,基因foldchange很大,但是统计学不显著
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在用二代测序数据fpkm或者readcounts进行差异分析的时候,基因的表达丰度并不低的情况下,为什么会出现基因foldchange很大,但是统计学不显著p值不显著的情况?,统计学显著性理论上就是检验表达差异性的,foldchange差异很大的情况,p-value应该很小才对,求解,谢谢!!举例如下(cuffdiff 结果,DESeq也有类似情况): transcript_id gene_id gene_name gene_location KO_FPKM WT_FPKM log2(foldchange) pvalue qvalue ENSMUST00000115118 ENSMUSG00000031095 Cul4b chrX:38533273-38576196 2.01117 10.7411 -2.41703 0.07125 0.999514 |
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