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jianjunjiang铁杆木虫 (正式写手)
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[求助]
请问能不能用matlab读取gromacs软件的计算结果(比如说.xtc格式的文件) 已有1人参与
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各位大侠: 请问能不能用matlab读取gromacs软件的计算结果(比如说.xtc格式的文件),先谢了!! |
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brucefan
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2楼2016-06-13 22:25:36
lsloneil
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
jianjunjiang: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-06-14 16:24:58
感谢参与,应助指数 +1
jianjunjiang: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2016-06-14 16:24:58
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不行,xtc文件是具有特定格式的二进制文件,matlab没有相应的插件没法读。 通常自编程处理(fortran, c++)的做法是先编译一个读取xtc文件的库,然后在处理数据的程序中调用这个库,具体参见 http://www.gromacs.org/Developer ... g_Guide/XTC_Library http://manual.gromacs.org/online/xtc.html 还有一种方法是用分子模拟处理数据的软件比如VMD或者MDAnalysis,它们可以读取xtc文件,然后你可以调这些软件里的命令进行数据分析。 如果你非要用matlab,需要先用gromacs 里的trjconv命令把xtc文件转化成非二进制文件的格式比如gro或者pdb,然后再用matlab读取。 |
3楼2016-06-14 15:19:21












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