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wbb645

木虫 (小有名气)

[求助] 重叠延pcr总是出现很亮的杂带,求大神指教已有1人参与

最近做重叠PCR,两个需重叠的基因分别为启动子1200bp,终止子800bp,linker为30bp,酶用的是2×Taq  Master Mix,反应条件如下:
反应条件如下:
第一轮10个循环
94℃×5min
94℃×30s
50℃×30s
72℃×2min30s
72℃×10min
第二轮30个循环
94℃×5min
94℃×30s
56℃×30s
72℃×2min30s
72℃×10min
体系为50微升:Taq  Master Mix 25微升、启动子1微升、终止子0.5微升、双蒸水21.5微升、上游引物1微升、下游引物1微升(由于终止子条带比启动子的亮的多,所以启动子加的多)
marker分别是8000,5000,3000,2000,1000、750、500、250、100bp
实验结果:总会出现800bp左右的杂带,导致无法胶回收,求教大神指点

重叠延pcr总是出现很亮的杂带,求大神指教
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werq63

金虫 (著名写手)

启动子pcr一般容易出现问题,你可以将片段回收再次PCr,或者重叠的时候提高退火温度

发自小木虫Android客户端
16楼2016-06-15 22:21:25
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