24小时热门版块排行榜    

查看: 6703  |  回复: 14
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

西大慢慢

铁虫 (著名写手)

[求助] 怎么鉴定crispr/cas9单敲和双敲小鼠 已有1人参与

各位大神,我想请教一个问题,我目前通过crispr/cas9系统敲除了小鼠某个基因,通过PCR获得了该基因的片段,通过测序发现敲除的片段只有20bp,因此不能通过凝胶电泳分离目的基因鉴定小鼠属于野生,单敲,双敲(如果敲除的片段足够大,通过凝胶电泳可以发现,双敲的片段小跑的距离远,野生的片段大跑的慢,单敲的会出现两条带从而鉴别开来)。但通过测序我们可以鉴定出野生型以及单敲、双敲,而不能区分双敲和单敲,因为它们的测序结果在敲除片段的峰都是杂峰。因而,我们将PCR产物通过TA克隆然后转入大肠杆菌中培养,然后随机的挑选菌落,每个菌落培养后,再测序,并且与该基因序列对比,如果有一条序列不完整为单敲,两条不完整为双敲。然后我的问题是,通过TA克隆的载体转入大肠杆菌后,连接不同的基因型载体的大肠杆菌是分布在不同的菌落吗?或者换句话说,将不同大小的基因片段克隆在同一种质粒载体转化进入大肠杆菌,在同一个培养皿中培养,它们会分布在不同的菌落上吗?或者你们是怎样鉴定这种小鼠基因型的

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西大慢慢

铁虫 (著名写手)

理论这样也可以,但是那个突变区要有酶切割位点

发自小木虫Android客户端
12楼2016-06-20 14:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

armigera

金虫 (正式写手)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-12 19:38:46
每个菌落都是由一种菌生长起来的,而每个菌里面的质粒在你能看到菌落的时候都是单一的(因为有质粒不兼容性),所以你这个方法理论上是可以的。可能会遇到不同大小质粒分布数量不同,但你这是定性实验,多挑几个就能解决。

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-06-12 09:00:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

armigera

金虫 (正式写手)

我们原来是在这20bp的区域设计引物,如果不能pcr出来说明双敲,p出来量少为单敲,量多为野生

发自小木虫Android客户端
3楼2016-06-12 09:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西大慢慢

铁虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by armigera at 2016-06-12 09:00:28
每个菌落都是由一种菌生长起来的,而每个菌里面的质粒在你能看到菌落的时候都是单一的(因为有质粒不兼容性),所以你这个方法理论上是可以的。可能会遇到不同大小质粒分布数量不同,但你这是定性实验,多挑几个就能 ...

谢谢,我再问一问可不可以通过聚丙烯酰胺凝胶电泳将片段为20bp差异的分开,如果可以的话就可以不用测序了

发自小木虫Android客户端
4楼2016-06-12 10:36:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料292调剂 +6 橘颂思美人 2026-03-23 6/300 2026-03-24 13:32 by 连洋洋洋
[考研] 生物学学硕求调剂 +6 小羊睡着了? 2026-03-23 6/300 2026-03-24 13:22 by 李常安
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-17 10/500 2026-03-23 13:05 by 醉在风里
[考研] 070300,一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
信息提示
请填处理意见