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lfjsxb1113

金虫 (正式写手)

[交流] diamond3请问如何根据对称码画氢键

大牛们,请进来看一看,刚开始学diamond软件作图,需要画氢键,现在遇到3个大问题。
1、怎么根据对称码画氢键,画氢键已经学会。 了,但是没有办法跟cif给出的对称码搭上勾,
2、怎么样才能够直接在图上增加晶胞,我不要那种增加的晶胞图里的分子没有连好化学键的(需要自己点击连接按钮才能连好原子晶胞,这样子连化学键我的总是会连错,把六元环和甲基掉在外面,我的方法就是通过fill里面,改变range或者是super cell,还有就是在打开cif时的画图帮助框里面改变range,但是这样增加的晶胞分子总是没有连接好,而导致后面连接出错),
3、在原子边上添加原子序号的时候,怎么样才能把对称代码“i”和“ii”以上标的形式标在序号后边,比如H33Ai,i要上标
希望这些问题同时也能帮助正在学软件的人,大牛们,现在你正在被需要,快快过来为我们小白授业解惑吧,谢谢您们,也衷心感谢小木虫这个平台给我提问请教的机会

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lfjsxb1113

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 手心太阳 at 2016-06-12 22:25:05
我帮你顶下

谢谢,问题已经解决啦

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4楼2016-06-12 23:46:32
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zhuyl9160

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主,求问题3该如何解决?

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越努力,越幸运
10楼2016-09-19 15:52:54
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普通回帖

lfjsxb1113

金虫 (正式写手)

怎么没有人回复呢?大牛们都过节休息了是吗?还是我的问题太过于简单了。可是真的遇到难题了,希望大家过来帮助下

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2楼2016-06-10 19:31:07
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手心太阳

银虫 (著名写手)

3楼2016-06-12 22:25:05
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lfjsxb1113

金虫 (正式写手)

问题已经解决啦,如果有碰到以上问题的人可以留言,上面三个问题基本已经解决啦,只是一下子说不清

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5楼2016-06-12 23:48:10
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碧海星

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
对1和2还是不太理解

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6楼2016-06-13 01:28:02
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lfjsxb1113

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 碧海星 at 2016-06-13 01:28:02
对1和2还是不太理解

1的话你要找到对称码里面的两个坐标分子,它的作用就是为了确定两个通过氢键连接的两个分子,只要对称码上的两个分子连好,晶胞堆积图上所有的氢键都出来了
对于2,你增加了晶胞数量以后,不要点那个正方形带个叉的框框(connect atoms)来连接原子,点击那个带黄色的六元环那个框框(complete fragments),这样就能直接把你晶胞里面的散落的原子正确连接。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2016-06-13 08:04:33
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碧海星

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by lfjsxb1113 at 2016-06-13 08:04:33
1的话你要找到对称码里面的两个坐标分子,它的作用就是为了确定两个通过氢键连接的两个分子,只要对称码上的两个分子连好,晶胞堆积图上所有的氢键都出来了
对于2,你增加了晶胞数量以后,不要点那个正方形带个叉的 ...

谢谢

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8楼2016-06-13 08:36:55
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匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
9楼2016-06-28 14:57:28
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