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sinodina

木虫 (小有名气)

[交流] 求助内含子分析

我现在有一种植物的研究较多的蛋白的基因组序列,但是没有cDNA序列,网上也没有相关记录,现在想分析他的内含子,如何分析?希望各位能帮忙!
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boouy

银虫 (正式写手)

2楼2008-11-05 10:33:56
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sinodina

木虫 (小有名气)

多谢,但是我在NCBI上比对时发现这段序列应该是有两个内含子,三段外显子,当然由于是片段,前后两个外显子是不全的,用genescan分析出来只有中间那段外显子,其余两端的外显子他都没有显示,这样我就不好确认两端的位置,这是怎么回事呢,能通过修改参数来改善吗?
3楼2008-11-06 09:35:28
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anne_ncpc

银虫 (初入文坛)


司马诸葛(金币+1,VIP+0):奖励一下 8-8 17:45
做RT-PCR得到cDNA后才能明确两个内含子的位置,这样才能进行下一步的分析:构建内含子-GUS的双元表达载体,转化植物做瞬时表达,分析内含子的作用。
4楼2008-11-10 10:38:37
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