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葬春1993

新虫 (小有名气)


[交流] VASP计算矿物层状结构的尝试

本人研究白云母2:1层状结构,结构如下:,效果图:http://muchongimg.xmcimg.com/data/b ... _1465266329_433.jpg
其中硅氧四面体中的硅有1/4被铝取代,使2:1层带负点,所以层间用阳离子平衡电荷。
    在建立模型前,考虑到我的计算资源有限只能使用16个核,单胞有80多个原子,所以我采用原胞进行计算,结构如下:http://muchongimg.xmcimg.com/data/b ... _1465266457_935.jpg
    建模时,由于有非等价的硅铝取代,即需要平衡电荷的引入,所以我考虑用slab模型进行尝试。
    首先,需要建立无硅铝取代的结构模型,将层间阳离子去掉;
    然后,进行cut-off和k-points收敛性测试,发现截断能在800eV才趋于稳定,这是为什么呢?
    接着建立slab模型,我只取了一个2:1层状结构,扩成2x2x1的超胞(大概80多个原子),http://muchongimg.xmcimg.com/data/b ... _1465267498_920.jpg,考虑到c轴方向的非周期性,我人为的固定了底面的硅氧四面体层,只改变真空层厚度,进行测试,发现真空层厚度在25埃才趋稳,这样我的基础模型就建好了。
    最后,就是进行铝取代硅,加入钾离子为电荷平衡离子,结构优化后个别键长比实际的白云母结构短0.05埃。
这样的模型可不可靠呢?周围没有人做这方面的,我也是新手,所以感觉很虚~~希望大家针对我建模的过程给出指导和不足!!谢谢!!

VASP计算矿物层状结构的尝试
白云母.jpg


VASP计算矿物层状结构的尝试-1
白云母 Image.jpg


VASP计算矿物层状结构的尝试-2
原胞.jpg
VASP计算矿物层状结构的尝试-3
slab模型.jpg
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葬春1993

新虫 (小有名气)


送红花一朵
引用回帖:
29楼: Originally posted by emilyoyang at 2016-06-11 21:33:49
你问题中提到了slab,大家都认为你做表面计算。
但你又说掺杂,一般大家都做体相结构掺杂。
所以 现在的问题是  你想做表面研究 还是体相研究?
如果体相,那你的slab模型肯定不对。
如果是表面掺杂,你的模型 ...

谢谢你的回复!!我本来准备做体相掺杂,但是掺杂前的白云母结构中,原本就有一部分硅被铝取代,一个晶胞中总共四层16个硅,有四个被铝取代,每层有四个取代位,组合太多,所以白云母的基础模型很难建立,我是想只取晶胞中的一层,并做表面那层硅被铝取代,这样总共就只有4个硅原子,即使扩胞后也很少,同时,在硅铝取代后,结构电荷不平衡,考虑到原始白云母结构中层间有钾离子平衡电荷,所以我就想通过slab模型来做钾离子吸附,从而靠近原始白云母结构。这个slab模型被我当作理想的白云母结构来进行其他原子的取代掺杂!!我知道这样的模样感觉不伦不类,但是没有更好的办法了~~
对于截断能测试,我是以原胞无硅铝取代去钾,共40个原子进行测试,测试结果是这样的:
400  -294.426485
450  -294.015464
500  -293.903562
550  -293.928305
600  -293.997559
650  -294.060051
700  -294.108222
750  -294.131795
800  -294.146404
850  -294.149370
900  -294.149391
到800后相差<0.01,所以选的800。
你看有没有问题!!

发自小木虫Android客户端
30楼2016-06-12 10:51:24
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2016-06-07 10:52   回复  
葬春1993(金币+1): 谢谢参与
祝福祝福祝福祝福祝福祝福祝福祝福
2016-06-07 19:07   回复  
葬春1993(金币+1): 谢谢参与
祝福 发自小木虫IOS客户端
skyish10楼
2016-06-07 19:14   回复  
葬春1993(金币+1): 谢谢参与
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挑战0111楼
2016-06-07 19:33   回复  
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2016-06-07 19:34   回复  
葬春1993(金币+1): 谢谢参与
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shwkfd14楼
2016-06-09 16:49   回复  
葬春1993(金币+1): 谢谢参与
祝福 发自小木虫IOS客户端
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