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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

[求助] 菜鸟求助。。。Dmol3研究汞在表面的吸附 已有1人参与

1.用Dmol3研究汞在表面的吸附,直接画汞原子粘贴到真空层中么?汞原子是否需要进行结构优化?在绘制汞原子的晶格时晶格常数根据什么确定呢?

2.将汞原子粘贴到真空层的什么位置呢,是根据什么进行计算。。。

实验室只有我一个人研究反应机理,全都靠自学。。。苦于无人交流。。。许多问题比较低级希望大神不吝赐教啊。。。
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我想你要走了

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by Ccfreesia at 2016-06-06 12:55:21
谢谢!!!!!!我看文献过程中还是有一点不太明白,比方说先选定一个吸附位,然后要把被吸附原子放在离吸附原子多远的位置上呢,求指导~~...

单原子吸附的话桥位B是表面两原子中间点,八面体间隙O选择六个原子建中心点(creat centroid按钮),四面体间隙T吸附四个原子建中心点,把单原子加在中心点坐标处。
络合物吸附的话,原子间距离参照简单分子键长(CuCl2表面吸Hg,可参照HgCl2中Hg-Cl键长),键长可以参照文献或实验结论,也可以自己建模进行几何优化,然后测键长。一些软件(如gaussian)构建的时候会有键长范围,可以参照。

一般情况下,键长键角都会在几何优化后发生改变,使其达到较为稳定的位置,进行几何优化以前的模型一般都比较粗略,键长键角都是大概的范围,是否稳定可以根据最终焓等性质及几何优化后得到的.xtd文件辅助判断(点play按钮看键长键角变化)。

络合物吸附时小分子相对于大分子的空间位置我现在也不是很懂,在网上查到的说是添加到近似合理的位置。问了老师但没告诉我。。。

因为只接触这个一年多一点,老师讲的也不是很详细。许多意见不一定准确,仅供参考。
9楼2016-06-06 13:36:18
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Madajay

新虫 (正式写手)

我也是刚做这个,帮顶,你这个具体是什么的吸附

发自小木虫Android客户端
2楼2016-06-04 17:06:59
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Ccfreesia

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Madajay at 2016-06-04 17:06:59
我也是刚做这个,帮顶,你这个具体是什么的吸附

先尝试着用CuCl2做。。。万事开头难,各种问题。。。脑袋都大了
3楼2016-06-04 17:10:35
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Madajay

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Ccfreesia at 2016-06-04 17:10:35
先尝试着用CuCl2做。。。万事开头难,各种问题。。。脑袋都大了...

都一样啊,只能自己慢慢学习了,共勉吧

发自小木虫Android客户端
4楼2016-06-04 18:06:17
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