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A类错误
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_symmetry_cell_setting ? _symmetry_space_group_name_H-M Pna21 loop_ _symmetry_equiv_pos_as_xyz 'x, y, z' '-x, -y, z+1/2' 'x+1/2, -y+1/2, z' '-x+1/2, y+1/2, z+1/2' 通过platon得到： Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [ ARU ] D - H H...A D...A D - H...A A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ) Sum(XZ) ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1 1 C(3) --H(3A) ..O(3) [ 3554.01] 0.93 2.52 3.4500 173 2 Intra 1 C(5) --H(5A) ..O(4) [ ] 0.93 2.44 2.7634 100 3 Intra 1 C(7) --H(7A) ..Cl [ ] 0.93 2.63 2.9544 101 :: No Classic Hydrogen Bonds Found Translation of ARU-code to Equivalent Position Code =================================================== [ 3554. ] = 1/2-x,1/2+y,-1/2+z 在cif表内贴了氢键数据： loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag # #D H A D - H H...A D...A D - H...A symm(A) # C3 H3A O3 0.9300 2.5200 3.4500 173.00 3_554 yes C5 H5A O4 0.9300 2.4400 2.7634 100.00 . yes C7 H7A Cl 0.9300 2.6300 2.9544 101.00 . yes 经checkcif检查发现有3个A类错误： PLAT726_ALERT_1_A H...A Calc 16.84000, Rep 2.52000 Dev... 14.32 Ang. H3A -O3 1.555 3.554 PLAT727_ALERT_1_A D...A Calc 17.575(10), Rep 3.45000 Dev... 14.13 Ang. C3 -O3 1.555 3.554 PLAT728_ALERT_1_A D-H..A Calc 141.00, Rep 173.00 Dev... 32.00 Deg. C3 -H3A -O3 1.555 1.555 3.554 请各位高手帮忙 [ Last edited by wy_why007 on 2008-11-5 at 14:24 ] |
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xi2004
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