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lanwang

新虫 (初入文坛)

[求助] PCR一直跑不出来,排除了该排除的原因了还是跑不出来已有7人参与

我最近在提取黑曲霉基因组DNA,克隆特定的葡萄糖氧化酶基因,但我的菌株是菌种保藏中心购买的标准菌株,不是克隆我需要的特定基因的特定菌株,我开始提的RNA,再反转录成CDNA跑PCR,退火温度跑的是55-65℃的梯度,用的10微升体系,没跑出来,后来又提的DNA,同样是跑的温度梯度,我需要的目的基因是1818bp,所以用的是高保真酶,引物也设计了好几对了,都是公司帮设计的,应该没问题,CDNA和DNA的浓度以及OD值都正常,但是不管用什么方法都跑不出来,求大神啊,真不知道该怎么办了,试验就卡在第一步了,好焦心呐!!!!!电泳图上除了marker就什么都没有了,有时候有引物二聚体
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yesucao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+3, 赠人玫瑰·手有余香,谢谢你的理解与支持。myprayer祝您科研顺利,文章多多。 2016-06-01 22:27:08
xn8008: 应助指数+1 2016-07-17 08:03:46
一般这种常见的基因没必要自己设计引物,搜索相关的文献均可以查找到设计好且条件成熟的引物,核对一下引物序列和扩增条件,没有问题就可以采用,我查找到的网站链接如下:http://www.docin.com/p-1350669733.html
仅供楼主参考,以DNA为模板,建议反应体系加大到30ul,毕竟PCR扩增产物还是需要测序验证一下才行。
6楼2016-06-01 22:07:46
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