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Mr.四娃

金虫 (小有名气)

[求助] 怎样预测蛋白的RMSD,急求已有2人参与

如题,我近期一直在改造一个木聚糖酶,改造包括改变一些残基是结构更稳定,但是我看别的文章上边都是先预测下改完之后的RMSD,再进行试验,但是我试了好几次,不知道要怎么做,所以求教各位大神,有知道的帮我一下,真心感谢了。
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Mr.四娃

金虫 (小有名气)

请各位都看一下吧,谢谢
2楼2016-06-01 09:45:14
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Mr.四娃

金虫 (小有名气)

真心挺急的,谢谢
3楼2016-06-01 09:45:26
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4楼2016-06-01 09:59:03
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夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-06-04 22:05:10
有在线预测的,把pdb结构上传,会给出rmsd
5楼2016-06-02 01:07:52
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Mr.四娃

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 夏天的普洱茶 at 2016-06-02 01:07:52
有在线预测的,把pdb结构上传,会给出rmsd

网址有吗亲

发自小木虫Android客户端
6楼2016-06-04 16:08:51
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Pauline诗

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 夏天的普洱茶 at 2016-06-02 01:07:52
有在线预测的,把pdb结构上传,会给出rmsd

请问在线比对 除了用RCSB以外 还有啥推荐吗? 我上了很多在线预测有的不知道怎么操作
7楼2018-01-18 16:54:08
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Pauline诗

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by Mr.四娃 at 2016-06-04 16:08:51
网址有吗亲
...

RCSB  是一个网页 有很多算法 可以通过蛋白质结构 比对出RMSD
8楼2018-01-18 16:55:36
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