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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 关于SNP验证

通过基因组测序和转录组测序找到很多SNP位点,现在想挑选一些SNP位点进行相关性验证分析,但是这么多位点不可能都做,那问题来了,是多选一些基因、每个基因选几个位点做呢?还是选择性状相关的少数基因、每个基因内多选些位点做?有做过类似实验或是从理论上来分析大家觉得哪种策略更高效?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

有了解的或有想法的留个言呗
3楼2016-05-26 23:37:40
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-06-03 10:24:45
跟我这个好像差不多,我是先过滤一遍给的SNP位点,留下靠谱的,然后按一定间距选取位点。如果有感兴趣的基因再加上

你说的留下靠谱的,是根据什么依据呢?
7楼2016-06-03 14:12:12
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-06-03 10:24:45
跟我这个好像差不多,我是先过滤一遍给的SNP位点,留下靠谱的,然后按一定间距选取位点。如果有感兴趣的基因再加上

另外请教下你们是用什么方法验证SNP?
8楼2016-06-03 14:12:57
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