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nkleof

银虫 (正式写手)

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[求助] 关于源代码已有3人参与

想看看lammps源代码里面是如何计算原子间相互作用的，结果看来看去都没发现哪块是计算相互作用的，lammps的源代码写的很不容易看清楚啊。
从主程序main.cpp出发，里面除去MPI相关的函数，和创建一个lammps实例，剩下就一句话 lammps->input->file(); 调用lammps下的input类的file函数，处理输入文件。
这个file函数里面除去很多判断最后就落到parse函数，对命令进行解析，然后进入execute_command函数调用相应的命令处理函数，但是这里面没有run命令的处理函数。
以pair_style命令为例，对应的pair_style函数会将输入的命令参数（力场名称）和类force下的pair_style字符串比较（然而这个字符串的赋值始终没找到），如果符合就进入相应的settings函数。然后，这个settings函数里面一般就一行判断参数个数的语句就没了。
求高手指点一下，lammps源代码的结构是怎么样的？哪个文件里面包含了原子间相互作用的计算？

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1楼 2016-05-23 15:56:03

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tingl

铁虫 (初入文坛)

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楼主，我在编译lammps后，在bench及examples中测试都ok？但是一旦把我自己的in文件及data文件和势文件放在别的目录中，运行时就会首先出现cannot open log.lammps for writing 以及后面会跟着出现application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0。
但是我把我的in文件及data和势文件放在examples/crack中运行，就没有一点错误，，，这是什么原因造成的？
实在找不到人来求助了，楼主还请原谅！！