24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 642  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

upgo123

金虫 (小有名气)

[求助] 怎么寻找Slug Snail2转录因子的结合位点? 已有1人参与

如题,我找到了基因的启动子序列,如下,但怎么找 slug Snail2转录因子的结合位点?给我结果的同时请教我一下方法,谢谢!
Gene ID: 6591   /   Snail2   /   Slug Snail2
GAAAGGAAACCTCTGTCTTGTCTTAGCAGAGTCCCAGCAGCTGGCCTTTGGGTGTGGCCT
TGACTTCCCGGCTTGCGTTTTTACCACATGGTGCTGGCGCCACATGCCCTCCGCTGTGTC
TGAGCAGAGCACCTGTTTCGTCTGACTCACGCCATCAGCGCGCAGACTCGCCCTGCTCTG
ACAGCGGCCCAGACCTCACACGGGCATACGTGTTACTCGCTAGCACGCGGATCTGTGTAA
TGACATGCCCCATGCACAGACCCGAGCCCCATCCTCTCCTCACAGTAGGTGTGGCCGCAC
GTCCTGACGCCGATCTGTGCAGTGCACCCTCGGATACCTGCTGATGGGGCTGGGCTGGAT
TATGCCTCTGTGATCCAAATGTAAGCTTTTTTCATGCATAGTGAATTATTATTAAACGTT
GTAAATGGATTTTTGAATACACATTTTAGTAGATGATCTTGTGTTATAACTACCAGCAAA
TAAATACCAAAACATTGTCTAACACTCTTCTTTGTTGTGAATAGACTGTGTAGAGTGAAA
CAAGGAAATAATAGCCATGGCGATATGTGTTTTCTCAACTGTGCTATATCTGTAACAAAA
ATGTGTGTTTTGTGGGAAATGGAGTGAAAAGCAAGGAGGACTCCTGCTCTCATAAACCCA
GGTGCCTACATCCGAACAAACCCTCACATAGAGTAGCAAGCTTAGAAAACTGCCTCTGGC
TTTTACTCCAGGTTCCAGTTTGTGTGTGGAGAAATCGAATATGTATTCATATTTTCCTCT
CTCCTGCAAGTACAGTTCCATTAGCATAAGGATTCCTTTGAATTATTTTCTCTGTTTGAC
ATTTAAATTAGTGACTGTTGGAAGAAATAAGAATAATCATTGAAATTAGCTTAGGAAATC
TGTGAGTGCCCCACCTCACCCTCCAAACACACATACACTCTTGTTTTCTCATTCCAAGAT
TAAGAAGTTATGCAACCTGACAATGCACTTTTCTCTGACAAGTCTTGACATCACCACTGT
TATTTTCTTTTTCACTTTTTTCCTCCAGCACCTGTTAGAAACAAGAGTAGGGTGATCTTC
ATGTGAATTTGTTCTTTCCTTATTCTTTTAGCAAAAGATAGGGATAAAAGTCTGCAATGG
ACAGAGATGCTTTAAAATATGCTTGAAATTTTATATTTAAAATAAACCACCTGAAAGTAT
TTTTAGATTGAAGACCATACACAAAATAAAGGTGTTTTTGCAGTTACTAGACTGGGTTCT
TAAAACTTTAATCAATCTATATTCATAATAATATCCTTCAATTTCTTTTTTAGCATTATA
CAGGAAACTGGTAGATACTGAGATGGATTTTAATGGCTTTATACTGATGAAAATAGCACC
ACATAAAAGCAGGGGAATATTAGAAATAAAAATAATTGTCTCTAAAGACCCATACAACCC
TTTTTCCCATAAAAAAAAAGATGCACTGTAATACATGAAAAGATAAGATCTCTTGTCAAA
AGTGTGAGAGAATGTCCGGTGGTTCCAAATGACAGTTACCTCTTGCCCCCCTTCTCTGCC
AGAGTTCCTTTTTATCTTTGCAATCTTCCAGTTCTTCCGATCAGCCTGCCTTTAGAGGGC
TACAAAGCATTTCTTTCAAGCCACCATAGCTAACACGGTGACATGAGTACTTAATTTGCA
CGCGGCCGCGCTGCCCCTGGCTTCGCGGAAGCCCTGAGTAGCGCAGCGCCCTCGCCGCAC
GCAAGGCTGCAGTCCCGCTCCAGGCCAGAGTCCCAGGAGAGCGTCCTCCGCGCTCACAGG
CGCCTTTGTCTTCCCGCTTCCCCCTTCCTTTTTCAAAAGCCAAGAGGTAATTATTTGGTC
TTTGTGCAAGGCAAACCTCTCCAGATGCCACTTCCAAATATAGGCTCTCATTAACACCAG
AGGCTGGCCTGGTGTGGTGCAGGGCGGCCCTTCCTTCTCCTGGCGGACACTGTGTCCCCG
CGCGCTGGCGCTGCACCACA
回复此楼
选择,然后坚持
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

upgo123

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiadongliang at 2016-05-17 14:04:42
http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3

做这个上面预测下。

怎么预测,能教我一下吗?alggen里面没有收录slug/snail2位点信息

发自小木虫Android客户端
选择,然后坚持
3楼2016-05-18 08:16:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
2楼2016-05-17 14:04:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856专硕求调剂 希望是a区院校 +23 好好休息好不好 2026-04-09 26/1300 2026-04-13 14:22 by 张zhihao
[考研] 一志愿双非085400电子信息344 求调剂,对材料和化学方向也感兴趣 +12 无情的小羊 2026-04-09 13/650 2026-04-13 14:17 by 张zhihao
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +8 慕绝cc 2026-04-09 8/400 2026-04-13 14:08 by 张zhihao
[考研] 生物学调剂 +11 小冉要努力 2026-04-10 13/650 2026-04-13 11:46 by 电化学及催化
[基金申请] 山东省基金2026 +5 jerry681 2026-04-08 6/300 2026-04-12 08:33 by kudofaye
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 求调剂 +18 MAX怅惘 2026-04-09 20/1000 2026-04-11 23:31 by zhen~
[考研] 300分求调剂 (085501机械专硕,本科扬大) +8 xu@841019 2026-04-11 8/400 2026-04-11 10:46 by qingpingzhu
[考研] 机械专硕270求调剂,接受跨专业 +12 老师看看我吧aba 2026-04-09 14/700 2026-04-11 10:21 by laoshidan
[考研] 337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 08:57 by zhq0425
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 08工学 309分求调剂 +6 Yin DY 2026-04-08 6/300 2026-04-10 09:18 by Delta2012
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
[考研] 275 求调剂 +8 Lei812514 2026-04-07 8/400 2026-04-08 12:46 by chemisry
[考研] 22408 调剂材料 +7 我叫ez 2026-04-06 8/400 2026-04-07 17:12 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿西电085401求调剂 +4 sunw1306 2026-04-07 4/200 2026-04-07 16:40 by 啵啵啵0119
信息提示
请填处理意见