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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 怎么寻找Slug Snail2转录因子的结合位点？
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upgo123

金虫 (小有名气)

[求助] 怎么寻找Slug Snail2转录因子的结合位点？ 已有1人参与

如题，我找到了基因的启动子序列，如下，但怎么找 slug Snail2转录因子的结合位点？给我结果的同时请教我一下方法，谢谢！
Gene ID: 6591   /   Snail2   /   Slug Snail2
GAAAGGAAACCTCTGTCTTGTCTTAGCAGAGTCCCAGCAGCTGGCCTTTGGGTGTGGCCT
TGACTTCCCGGCTTGCGTTTTTACCACATGGTGCTGGCGCCACATGCCCTCCGCTGTGTC
TGAGCAGAGCACCTGTTTCGTCTGACTCACGCCATCAGCGCGCAGACTCGCCCTGCTCTG
ACAGCGGCCCAGACCTCACACGGGCATACGTGTTACTCGCTAGCACGCGGATCTGTGTAA
TGACATGCCCCATGCACAGACCCGAGCCCCATCCTCTCCTCACAGTAGGTGTGGCCGCAC
GTCCTGACGCCGATCTGTGCAGTGCACCCTCGGATACCTGCTGATGGGGCTGGGCTGGAT
TATGCCTCTGTGATCCAAATGTAAGCTTTTTTCATGCATAGTGAATTATTATTAAACGTT
GTAAATGGATTTTTGAATACACATTTTAGTAGATGATCTTGTGTTATAACTACCAGCAAA
TAAATACCAAAACATTGTCTAACACTCTTCTTTGTTGTGAATAGACTGTGTAGAGTGAAA
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ATGTGTGTTTTGTGGGAAATGGAGTGAAAAGCAAGGAGGACTCCTGCTCTCATAAACCCA
GGTGCCTACATCCGAACAAACCCTCACATAGAGTAGCAAGCTTAGAAAACTGCCTCTGGC
TTTTACTCCAGGTTCCAGTTTGTGTGTGGAGAAATCGAATATGTATTCATATTTTCCTCT
CTCCTGCAAGTACAGTTCCATTAGCATAAGGATTCCTTTGAATTATTTTCTCTGTTTGAC
ATTTAAATTAGTGACTGTTGGAAGAAATAAGAATAATCATTGAAATTAGCTTAGGAAATC
TGTGAGTGCCCCACCTCACCCTCCAAACACACATACACTCTTGTTTTCTCATTCCAAGAT
TAAGAAGTTATGCAACCTGACAATGCACTTTTCTCTGACAAGTCTTGACATCACCACTGT
TATTTTCTTTTTCACTTTTTTCCTCCAGCACCTGTTAGAAACAAGAGTAGGGTGATCTTC
ATGTGAATTTGTTCTTTCCTTATTCTTTTAGCAAAAGATAGGGATAAAAGTCTGCAATGG
ACAGAGATGCTTTAAAATATGCTTGAAATTTTATATTTAAAATAAACCACCTGAAAGTAT
TTTTAGATTGAAGACCATACACAAAATAAAGGTGTTTTTGCAGTTACTAGACTGGGTTCT
TAAAACTTTAATCAATCTATATTCATAATAATATCCTTCAATTTCTTTTTTAGCATTATA
CAGGAAACTGGTAGATACTGAGATGGATTTTAATGGCTTTATACTGATGAAAATAGCACC
ACATAAAAGCAGGGGAATATTAGAAATAAAAATAATTGTCTCTAAAGACCCATACAACCC
TTTTTCCCATAAAAAAAAAGATGCACTGTAATACATGAAAAGATAAGATCTCTTGTCAAA
AGTGTGAGAGAATGTCCGGTGGTTCCAAATGACAGTTACCTCTTGCCCCCCTTCTCTGCC
AGAGTTCCTTTTTATCTTTGCAATCTTCCAGTTCTTCCGATCAGCCTGCCTTTAGAGGGC
TACAAAGCATTTCTTTCAAGCCACCATAGCTAACACGGTGACATGAGTACTTAATTTGCA
CGCGGCCGCGCTGCCCCTGGCTTCGCGGAAGCCCTGAGTAGCGCAGCGCCCTCGCCGCAC
GCAAGGCTGCAGTCCCGCTCCAGGCCAGAGTCCCAGGAGAGCGTCCTCCGCGCTCACAGG
CGCCTTTGTCTTCCCGCTTCCCCCTTCCTTTTTCAAAAGCCAAGAGGTAATTATTTGGTC
TTTGTGCAAGGCAAACCTCTCCAGATGCCACTTCCAAATATAGGCTCTCATTAACACCAG
AGGCTGGCCTGGTGTGGTGCAGGGCGGCCCTTCCTTCTCCTGGCGGACACTGTGTCCCCG
CGCGCTGGCGCTGCACCACA
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选择，然后坚持
1楼 2016-05-17 13:52:20
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin ... it.cgi?dirDB=TF_8.3

做这个上面预测下。
赞一下 回复此楼
2楼2016-05-17 14:04:42
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upgo123

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiadongliang at 2016-05-17 14:04:42
http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.3

做这个上面预测下。

怎么预测，能教我一下吗？alggen里面没有收录slug/snail2位点信息

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
选择，然后坚持
3楼2016-05-18 08:16:22
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