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lusandanooo

银虫 (小有名气)

[求助] 如何预测蛋白的活性位点啊? 已有2人参与

新手菜鸟,用autodock做分子对接,对接结果显示ligand周围有几个氨基酸,我想知道这些氨基酸是不是活性位点。我做的这个蛋白没有相似度很高的已知晶体结构,也没有文献报道过其活性位点。希望各位虫友们能推荐一些预测活性位点的在线网站,不胜感激!
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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

你的蛋白结构从哪里获得?同源建模可以参考模板蛋白
6楼2016-05-23 11:28:19
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殷赋科技

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lusandanooo: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-05-24 17:15:13
网上搜索一下一大堆,不妨看看这个:“http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/COACH/”。
2楼2016-05-13 17:41:47
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lusandanooo

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 殷赋科技 at 2016-05-13 17:41:47
网上搜索一下一大堆,不妨看看这个:“http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/COACH/”。

我不求一大堆……您能给我说一个好用免费的就行……

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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
3楼2016-05-14 11:10:38
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好孩子坏孩子

金虫 (著名写手)

这个好像是没有比较直观的方法,只能根据前人经验推测

发自小木虫Android客户端
5楼2016-05-16 23:31:40
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